Protein–RNA interactions for Protein: P41247

PNPLA4, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA4P41247 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNPLA4P41247 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNPLA4P41247 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PNPLA4P41247 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PNPLA4P41247 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PNPLA4P41247 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNPLA4P41247 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNPLA4P41247 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNPLA4P41247 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNPLA4P41247 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNPLA4P41247 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNPLA4P41247 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNPLA4P41247 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNPLA4P41247 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNPLA4P41247 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PNPLA4P41247 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PNPLA4P41247 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PNPLA4P41247 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PNPLA4P41247 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PNPLA4P41247 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PNPLA4P41247 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PNPLA4P41247 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNPLA4P41247 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNPLA4P41247 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNPLA4P41247 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNPLA4P41247 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNPLA4P41247 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PNPLA4P41247 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNPLA4P41247 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNPLA4P41247 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNPLA4P41247 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNPLA4P41247 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNPLA4P41247 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNPLA4P41247 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNPLA4P41247 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNPLA4P41247 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNPLA4P41247 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNPLA4P41247 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNPLA4P41247 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNPLA4P41247 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNPLA4P41247 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PNPLA4P41247 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNPLA4P41247 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms