Protein–RNA interactions for Protein: P19878

NCF2, Neutrophil cytosol factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF2P19878 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCF2P19878 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCF2P19878 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCF2P19878 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCF2P19878 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCF2P19878 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCF2P19878 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCF2P19878 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCF2P19878 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCF2P19878 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCF2P19878 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCF2P19878 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCF2P19878 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCF2P19878 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCF2P19878 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCF2P19878 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCF2P19878 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCF2P19878 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCF2P19878 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCF2P19878 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCF2P19878 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCF2P19878 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCF2P19878 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCF2P19878 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCF2P19878 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCF2P19878 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCF2P19878 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCF2P19878 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCF2P19878 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCF2P19878 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCF2P19878 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCF2P19878 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCF2P19878 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCF2P19878 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCF2P19878 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCF2P19878 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCF2P19878 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCF2P19878 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NCF2P19878 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCF2P19878 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCF2P19878 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCF2P19878 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCF2P19878 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCF2P19878 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCF2P19878 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCF2P19878 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCF2P19878 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCF2P19878 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCF2P19878 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF2P19878 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF2P19878 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF2P19878 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF2P19878 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCF2P19878 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCF2P19878 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCF2P19878 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCF2P19878 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCF2P19878 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCF2P19878 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCF2P19878 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCF2P19878 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCF2P19878 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NCF2P19878 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCF2P19878 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCF2P19878 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCF2P19878 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCF2P19878 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCF2P19878 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCF2P19878 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCF2P19878 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NCF2P19878 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCF2P19878 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCF2P19878 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCF2P19878 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCF2P19878 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCF2P19878 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCF2P19878 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCF2P19878 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCF2P19878 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCF2P19878 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCF2P19878 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCF2P19878 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCF2P19878 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NCF2P19878 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCF2P19878 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCF2P19878 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCF2P19878 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCF2P19878 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCF2P19878 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCF2P19878 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCF2P19878 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCF2P19878 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCF2P19878 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCF2P19878 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCF2P19878 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCF2P19878 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCF2P19878 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCF2P19878 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCF2P19878 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCF2P19878 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms