Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOSP01100 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOSP01100 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOSP01100 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOSP01100 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOSP01100 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOSP01100 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOSP01100 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOSP01100 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOSP01100 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOSP01100 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOSP01100 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOSP01100 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOSP01100 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOSP01100 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOSP01100 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOSP01100 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOSP01100 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOSP01100 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOSP01100 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOSP01100 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOSP01100 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOSP01100 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOSP01100 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOSP01100 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOSP01100 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOSP01100 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FOSP01100 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FOSP01100 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FOSP01100 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOSP01100 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOSP01100 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOSP01100 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOSP01100 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOSP01100 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOSP01100 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOSP01100 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOSP01100 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
FOSP01100 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOSP01100 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOSP01100 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
FOSP01100 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOSP01100 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOSP01100 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOSP01100 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOSP01100 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOSP01100 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOSP01100 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOSP01100 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOSP01100 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOSP01100 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOSP01100 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOSP01100 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOSP01100 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOSP01100 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
FOSP01100 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOSP01100 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOSP01100 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOSP01100 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOSP01100 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOSP01100 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FOSP01100 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOSP01100 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOSP01100 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOSP01100 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOSP01100 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOSP01100 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOSP01100 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOSP01100 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOSP01100 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOSP01100 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOSP01100 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOSP01100 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOSP01100 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOSP01100 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOSP01100 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOSP01100 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOSP01100 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOSP01100 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOSP01100 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOSP01100 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOSP01100 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOSP01100 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOSP01100 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOSP01100 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOSP01100 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOSP01100 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOSP01100 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOSP01100 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOSP01100 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOSP01100 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FOSP01100 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOSP01100 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOSP01100 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOSP01100 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOSP01100 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOSP01100 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOSP01100 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOSP01100 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FOSP01100 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms