Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRAMEF12O95522 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEF12O95522 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEF12O95522 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRAMEF12O95522 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEF12O95522 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRAMEF12O95522 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRAMEF12O95522 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRAMEF12O95522 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF12O95522 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF12O95522 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF12O95522 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF12O95522 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRAMEF12O95522 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF12O95522 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF12O95522 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF12O95522 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF12O95522 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRAMEF12O95522 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRAMEF12O95522 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRAMEF12O95522 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRAMEF12O95522 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRAMEF12O95522 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF12O95522 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRAMEF12O95522 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRAMEF12O95522 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRAMEF12O95522 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRAMEF12O95522 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRAMEF12O95522 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF12O95522 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEF12O95522 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEF12O95522 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEF12O95522 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEF12O95522 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEF12O95522 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRAMEF12O95522 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRAMEF12O95522 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRAMEF12O95522 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRAMEF12O95522 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PRAMEF12O95522 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRAMEF12O95522 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF12O95522 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF12O95522 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF12O95522 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF12O95522 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF12O95522 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF12O95522 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF12O95522 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF12O95522 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF12O95522 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms