RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611205.4

CDKN3-211, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CDKN3, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3-211ENST00000611205 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.21■■■■■ 7.39
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CDKN3-211ENST00000611205 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.01■■■■■ 6.4
CDKN3-211ENST00000611205 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.38■■■■■ 5.98
CDKN3-211ENST00000611205 NACADO15069 1562 aa51.97■■■■■ 5.91
CDKN3-211ENST00000611205 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.77■■■■■ 5.88
CDKN3-211ENST00000611205 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.64■■■■■ 5.86
CDKN3-211ENST00000611205 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.3■■■■■ 5.8
CDKN3-211ENST00000611205 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.24■■■■■ 5.79
CDKN3-211ENST00000611205 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.18■■■■■ 5.78
CDKN3-211ENST00000611205 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.84■■■■■ 5.73
CDKN3-211ENST00000611205 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.71■■■■■ 5.71
CDKN3-211ENST00000611205 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.52■■■■■ 5.68
CDKN3-211ENST00000611205 SCRIBQ14160 1630 aa50.17■■■■■ 5.62
CDKN3-211ENST00000611205 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.08■■■■■ 5.61
CDKN3-211ENST00000611205 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.75■■■■■ 5.56
CDKN3-211ENST00000611205 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.62■■■■■ 5.53
CDKN3-211ENST00000611205 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.59■■■■■ 5.53
CDKN3-211ENST00000611205 NCAPD3P42695 1498 aa47.94■■■■■ 5.26
CDKN3-211ENST00000611205 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.82■■■■■ 5.25
CDKN3-211ENST00000611205 SMARCA4P51532 1647 aa47.81■■■■■ 5.24
CDKN3-211ENST00000611205 SMARCA2P51531 1590 aa47.71■■■■■ 5.23
CDKN3-211ENST00000611205 HMGXB3Q12766 1538 aa47.62■■■■■ 5.21
CDKN3-211ENST00000611205 ERCC6Q03468 1493 aa47.57■■■■■ 5.21
CDKN3-211ENST00000611205 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.54■■■■■ 5.2
CDKN3-211ENST00000611205 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.45■■■■■ 5.19
CDKN3-211ENST00000611205 CUX2O14529 1486 aa47.44■■■■■ 5.18
CDKN3-211ENST00000611205 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.4■■■■■ 5.18
CDKN3-211ENST00000611205 NESP48681 1621 aa47.29■■■■■ 5.16
CDKN3-211ENST00000611205 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.28■■■■■ 5.16
CDKN3-211ENST00000611205 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.19■■■■■ 5.14
CDKN3-211ENST00000611205 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.94■■■■■ 5.1
CDKN3-211ENST00000611205 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.83■■■■■ 5.09
CDKN3-211ENST00000611205 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.75■■■■■ 5.07
CDKN3-211ENST00000611205 WIZO95785 1651 aa46.68■■■■■ 5.06
CDKN3-211ENST00000611205 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.63■■■■■ 5.06
CDKN3-211ENST00000611205 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.49■■■■■ 5.03
CDKN3-211ENST00000611205 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.26■■■■■ 5
CDKN3-211ENST00000611205 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.15■■■■■ 4.98
CDKN3-211ENST00000611205 WDR62O43379 1518 aa46.14■■■■■ 4.98
CDKN3-211ENST00000611205 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.08■■■■■ 4.97
CDKN3-211ENST00000611205 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.03■■■■■ 4.96
CDKN3-211ENST00000611205 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.01■■■■■ 4.96
CDKN3-211ENST00000611205 CFTRP13569 1480 aa45.95■■■■■ 4.95
CDKN3-211ENST00000611205 PRDM2Q13029 1718 aa45.65■■■■■ 4.9
CDKN3-211ENST00000611205 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.63■■■■■ 4.9
CDKN3-211ENST00000611205 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.49■■■■■ 4.87
CDKN3-211ENST00000611205 TRIM41Q8WV44 630 aa45.45■■■■■ 4.87
CDKN3-211ENST00000611205 OSCARQ8IYS5 282 aa45.26■■■■■ 4.84
CDKN3-211ENST00000611205 TOPBP1Q92547 1522 aa45.14■■■■■ 4.82
CDKN3-211ENST00000611205 IFT140Q96RY7 1462 aa45.13■■■■■ 4.82
CDKN3-211ENST00000611205 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.09■■■■■ 4.81
CDKN3-211ENST00000611205 ABCC8Q09428 1581 aa45.01■■■■■ 4.8
CDKN3-211ENST00000611205 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.99■■■■■ 4.79
CDKN3-211ENST00000611205 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.89■■■■■ 4.78
CDKN3-211ENST00000611205 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.76■■■■■ 4.76
CDKN3-211ENST00000611205 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.76■■■■■ 4.76
CDKN3-211ENST00000611205 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.76■■■■■ 4.76
CDKN3-211ENST00000611205 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.75■■■■■ 4.75
CDKN3-211ENST00000611205 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.66■■■■■ 4.74
CDKN3-211ENST00000611205 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.66■■■■■ 4.74
CDKN3-211ENST00000611205 CHD1O14646 1710 aa44.62■■■■■ 4.73
CDKN3-211ENST00000611205 ARHGEF11O15085 1522 aa44.57■■■■■ 4.73
CDKN3-211ENST00000611205 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.53■■■■■ 4.72
CDKN3-211ENST00000611205 SOGA1O94964 1423 aa44.45■■■■■ 4.71
CDKN3-211ENST00000611205 FBLN2P98095 1184 aa44.43■■■■■ 4.7
CDKN3-211ENST00000611205 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.4■■■■■ 4.7
CDKN3-211ENST00000611205 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
CDKN3-211ENST00000611205 CUX1P39880 1505 aa44.34■■■■■ 4.69
CDKN3-211ENST00000611205 WDR97A6NE52 1622 aa44.27■■■■■ 4.68
CDKN3-211ENST00000611205 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.24■■■■■ 4.67
CDKN3-211ENST00000611205 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.23■■■■■ 4.67
CDKN3-211ENST00000611205 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
CDKN3-211ENST00000611205 ARAP1Q96P48 1450 aa44.12■■■■■ 4.65
CDKN3-211ENST00000611205 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.08■■■■■ 4.65
CDKN3-211ENST00000611205 GRIN2BQ13224 1484 aa44.08■■■■■ 4.65
CDKN3-211ENST00000611205 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.06■■■■■ 4.64
CDKN3-211ENST00000611205 PBRM1Q86U86 1689 aa44.02■■■■■ 4.64
CDKN3-211ENST00000611205 SYNJ1O43426 1573 aa44.01■■■■■ 4.64
CDKN3-211ENST00000611205 CLASP1Q7Z460 1538 aa44■■■■■ 4.63
CDKN3-211ENST00000611205 SYNJ2O15056 1496 aa43.94■■■■■ 4.62
CDKN3-211ENST00000611205 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.92■■■■■ 4.62
CDKN3-211ENST00000611205 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.86■■■■■ 4.61
CDKN3-211ENST00000611205 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.84■■■■■ 4.61
CDKN3-211ENST00000611205 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.82■■■■■ 4.61
CDKN3-211ENST00000611205 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.66■■■■■ 4.58
CDKN3-211ENST00000611205 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.66■■■■■ 4.58
CDKN3-211ENST00000611205 TOP2BQ02880 1626 aa43.62■■■■■ 4.57
CDKN3-211ENST00000611205 GRIN2AQ12879 1464 aa43.52■■■■■ 4.56
CDKN3-211ENST00000611205 ADAMTS12P58397 1594 aa43.52■■■■■ 4.56
CDKN3-211ENST00000611205 CEP170Q5SW79 1584 aa43.4■■■■■ 4.54
CDKN3-211ENST00000611205 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.35■■■■■ 4.53
CDKN3-211ENST00000611205 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.35■■■■■ 4.53
CDKN3-211ENST00000611205 NUP160Q12769 1436 aa43.34■■■■■ 4.53
CDKN3-211ENST00000611205 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.32■■■■■ 4.52
CDKN3-211ENST00000611205 SHROOM2Q13796 1616 aa43.21■■■■■ 4.51
CDKN3-211ENST00000611205 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.97■■■■■ 4.47
CDKN3-211ENST00000611205 JPH4Q96JJ6 628 aa42.91■■■■■ 4.46
CDKN3-211ENST00000611205 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.91■■■■■ 4.46
CDKN3-211ENST00000611205 KIF27Q86VH2 1401 aa42.75■■■■■ 4.43
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