Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNGR4O95473 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNGR4O95473 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNGR4O95473 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGR4O95473 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNGR4O95473 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNGR4O95473 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.9 ms