Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKNO60260 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKNO60260 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKNO60260 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKNO60260 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKNO60260 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKNO60260 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKNO60260 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKNO60260 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKNO60260 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKNO60260 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKNO60260 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKNO60260 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKNO60260 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKNO60260 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKNO60260 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKNO60260 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKNO60260 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKNO60260 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKNO60260 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKNO60260 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKNO60260 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKNO60260 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKNO60260 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKNO60260 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKNO60260 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKNO60260 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKNO60260 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKNO60260 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKNO60260 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKNO60260 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKNO60260 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKNO60260 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKNO60260 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKNO60260 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKNO60260 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKNO60260 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKNO60260 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKNO60260 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKNO60260 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKNO60260 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKNO60260 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKNO60260 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKNO60260 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKNO60260 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKNO60260 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKNO60260 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKNO60260 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKNO60260 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKNO60260 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKNO60260 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKNO60260 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKNO60260 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKNO60260 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKNO60260 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKNO60260 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKNO60260 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKNO60260 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKNO60260 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKNO60260 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKNO60260 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKNO60260 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKNO60260 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKNO60260 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKNO60260 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKNO60260 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKNO60260 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKNO60260 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKNO60260 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKNO60260 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKNO60260 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKNO60260 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKNO60260 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKNO60260 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKNO60260 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKNO60260 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKNO60260 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKNO60260 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKNO60260 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKNO60260 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKNO60260 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKNO60260 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKNO60260 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKNO60260 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKNO60260 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKNO60260 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKNO60260 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKNO60260 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKNO60260 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKNO60260 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKNO60260 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKNO60260 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKNO60260 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKNO60260 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKNO60260 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKNO60260 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKNO60260 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKNO60260 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKNO60260 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKNO60260 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms