Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN6O43657 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN6O43657 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSPAN6O43657 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSPAN6O43657 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TSPAN6O43657 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSPAN6O43657 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSPAN6O43657 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN6O43657 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSPAN6O43657 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN6O43657 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.9 ms