Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP31

SH2D2A, SH2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D2AQ9NP31 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH2D2AQ9NP31 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH2D2AQ9NP31 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH2D2AQ9NP31 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2D2AQ9NP31 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2D2AQ9NP31 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2D2AQ9NP31 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2D2AQ9NP31 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2D2AQ9NP31 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH2D2AQ9NP31 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SH2D2AQ9NP31 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH2D2AQ9NP31 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH2D2AQ9NP31 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH2D2AQ9NP31 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH2D2AQ9NP31 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH2D2AQ9NP31 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH2D2AQ9NP31 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH2D2AQ9NP31 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH2D2AQ9NP31 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH2D2AQ9NP31 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH2D2AQ9NP31 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SH2D2AQ9NP31 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH2D2AQ9NP31 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SH2D2AQ9NP31 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2D2AQ9NP31 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2D2AQ9NP31 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2D2AQ9NP31 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2D2AQ9NP31 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2D2AQ9NP31 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2D2AQ9NP31 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH2D2AQ9NP31 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH2D2AQ9NP31 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2D2AQ9NP31 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2D2AQ9NP31 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2D2AQ9NP31 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2D2AQ9NP31 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SH2D2AQ9NP31 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH2D2AQ9NP31 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH2D2AQ9NP31 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH2D2AQ9NP31 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH2D2AQ9NP31 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH2D2AQ9NP31 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D2AQ9NP31 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D2AQ9NP31 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D2AQ9NP31 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D2AQ9NP31 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D2AQ9NP31 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D2AQ9NP31 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D2AQ9NP31 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D2AQ9NP31 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D2AQ9NP31 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH2D2AQ9NP31 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH2D2AQ9NP31 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D2AQ9NP31 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D2AQ9NP31 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D2AQ9NP31 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D2AQ9NP31 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH2D2AQ9NP31 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2D2AQ9NP31 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH2D2AQ9NP31 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2D2AQ9NP31 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2D2AQ9NP31 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2D2AQ9NP31 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SH2D2AQ9NP31 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH2D2AQ9NP31 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH2D2AQ9NP31 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH2D2AQ9NP31 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH2D2AQ9NP31 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH2D2AQ9NP31 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms