Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KDM1BQ8NB78 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM1BQ8NB78 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM1BQ8NB78 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM1BQ8NB78 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KDM1BQ8NB78 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM1BQ8NB78 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM1BQ8NB78 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM1BQ8NB78 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM1BQ8NB78 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM1BQ8NB78 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM1BQ8NB78 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM1BQ8NB78 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM1BQ8NB78 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KDM1BQ8NB78 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KDM1BQ8NB78 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KDM1BQ8NB78 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
KDM1BQ8NB78 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM1BQ8NB78 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KDM1BQ8NB78 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KDM1BQ8NB78 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KDM1BQ8NB78 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM1BQ8NB78 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM1BQ8NB78 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM1BQ8NB78 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM1BQ8NB78 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM1BQ8NB78 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM1BQ8NB78 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM1BQ8NB78 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM1BQ8NB78 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM1BQ8NB78 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM1BQ8NB78 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM1BQ8NB78 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM1BQ8NB78 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM1BQ8NB78 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM1BQ8NB78 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM1BQ8NB78 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM1BQ8NB78 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM1BQ8NB78 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM1BQ8NB78 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM1BQ8NB78 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM1BQ8NB78 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM1BQ8NB78 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM1BQ8NB78 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM1BQ8NB78 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM1BQ8NB78 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDM1BQ8NB78 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM1BQ8NB78 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM1BQ8NB78 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM1BQ8NB78 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM1BQ8NB78 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM1BQ8NB78 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM1BQ8NB78 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM1BQ8NB78 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM1BQ8NB78 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM1BQ8NB78 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM1BQ8NB78 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM1BQ8NB78 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM1BQ8NB78 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM1BQ8NB78 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM1BQ8NB78 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms