Protein–RNA interactions for Protein: Q86UD5

SLC9B2, Sodium/hydrogen exchanger 9B2, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B2Q86UD5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9B2Q86UD5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9B2Q86UD5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9B2Q86UD5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9B2Q86UD5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9B2Q86UD5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9B2Q86UD5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9B2Q86UD5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9B2Q86UD5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9B2Q86UD5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9B2Q86UD5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9B2Q86UD5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9B2Q86UD5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9B2Q86UD5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9B2Q86UD5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9B2Q86UD5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9B2Q86UD5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9B2Q86UD5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9B2Q86UD5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC9B2Q86UD5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC9B2Q86UD5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC9B2Q86UD5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9B2Q86UD5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9B2Q86UD5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9B2Q86UD5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9B2Q86UD5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9B2Q86UD5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9B2Q86UD5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9B2Q86UD5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9B2Q86UD5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9B2Q86UD5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9B2Q86UD5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9B2Q86UD5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9B2Q86UD5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9B2Q86UD5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9B2Q86UD5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9B2Q86UD5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9B2Q86UD5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9B2Q86UD5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9B2Q86UD5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9B2Q86UD5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9B2Q86UD5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9B2Q86UD5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9B2Q86UD5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9B2Q86UD5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9B2Q86UD5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC9B2Q86UD5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9B2Q86UD5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9B2Q86UD5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9B2Q86UD5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9B2Q86UD5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9B2Q86UD5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC9B2Q86UD5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9B2Q86UD5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC9B2Q86UD5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9B2Q86UD5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9B2Q86UD5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9B2Q86UD5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9B2Q86UD5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC9B2Q86UD5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms