Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWJ9

SNX30, Sorting nexin-30, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX30Q5VWJ9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX30Q5VWJ9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX30Q5VWJ9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX30Q5VWJ9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX30Q5VWJ9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNX30Q5VWJ9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX30Q5VWJ9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX30Q5VWJ9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNX30Q5VWJ9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX30Q5VWJ9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX30Q5VWJ9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX30Q5VWJ9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX30Q5VWJ9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX30Q5VWJ9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX30Q5VWJ9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX30Q5VWJ9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX30Q5VWJ9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX30Q5VWJ9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX30Q5VWJ9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX30Q5VWJ9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX30Q5VWJ9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SNX30Q5VWJ9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX30Q5VWJ9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX30Q5VWJ9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX30Q5VWJ9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX30Q5VWJ9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX30Q5VWJ9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX30Q5VWJ9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX30Q5VWJ9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX30Q5VWJ9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX30Q5VWJ9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX30Q5VWJ9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX30Q5VWJ9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX30Q5VWJ9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX30Q5VWJ9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX30Q5VWJ9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX30Q5VWJ9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX30Q5VWJ9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX30Q5VWJ9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX30Q5VWJ9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX30Q5VWJ9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SNX30Q5VWJ9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX30Q5VWJ9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX30Q5VWJ9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX30Q5VWJ9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX30Q5VWJ9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX30Q5VWJ9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX30Q5VWJ9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX30Q5VWJ9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX30Q5VWJ9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX30Q5VWJ9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX30Q5VWJ9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX30Q5VWJ9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX30Q5VWJ9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX30Q5VWJ9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX30Q5VWJ9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX30Q5VWJ9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX30Q5VWJ9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX30Q5VWJ9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX30Q5VWJ9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX30Q5VWJ9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX30Q5VWJ9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX30Q5VWJ9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX30Q5VWJ9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX30Q5VWJ9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX30Q5VWJ9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX30Q5VWJ9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX30Q5VWJ9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX30Q5VWJ9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX30Q5VWJ9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX30Q5VWJ9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX30Q5VWJ9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX30Q5VWJ9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX30Q5VWJ9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms