Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A20Q9NP91 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A20Q9NP91 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A20Q9NP91 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A20Q9NP91 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A20Q9NP91 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A20Q9NP91 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A20Q9NP91 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A20Q9NP91 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A20Q9NP91 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A20Q9NP91 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A20Q9NP91 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A20Q9NP91 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A20Q9NP91 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC6A20Q9NP91 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC6A20Q9NP91 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC6A20Q9NP91 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A20Q9NP91 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A20Q9NP91 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A20Q9NP91 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A20Q9NP91 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A20Q9NP91 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A20Q9NP91 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A20Q9NP91 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A20Q9NP91 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A20Q9NP91 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC6A20Q9NP91 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC6A20Q9NP91 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC6A20Q9NP91 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC6A20Q9NP91 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC6A20Q9NP91 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC6A20Q9NP91 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A20Q9NP91 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A20Q9NP91 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A20Q9NP91 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A20Q9NP91 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A20Q9NP91 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A20Q9NP91 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A20Q9NP91 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A20Q9NP91 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A20Q9NP91 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A20Q9NP91 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A20Q9NP91 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A20Q9NP91 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC6A20Q9NP91 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC6A20Q9NP91 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A20Q9NP91 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A20Q9NP91 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC6A20Q9NP91 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC6A20Q9NP91 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC6A20Q9NP91 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC6A20Q9NP91 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC6A20Q9NP91 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC6A20Q9NP91 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC6A20Q9NP91 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC6A20Q9NP91 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC6A20Q9NP91 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC6A20Q9NP91 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC6A20Q9NP91 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC6A20Q9NP91 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC6A20Q9NP91 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC6A20Q9NP91 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC6A20Q9NP91 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC6A20Q9NP91 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC6A20Q9NP91 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC6A20Q9NP91 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A20Q9NP91 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A20Q9NP91 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC6A20Q9NP91 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC6A20Q9NP91 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A20Q9NP91 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC6A20Q9NP91 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC6A20Q9NP91 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC6A20Q9NP91 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A20Q9NP91 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A20Q9NP91 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC6A20Q9NP91 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A20Q9NP91 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A20Q9NP91 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A20Q9NP91 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A20Q9NP91 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A20Q9NP91 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A20Q9NP91 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC6A20Q9NP91 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A20Q9NP91 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A20Q9NP91 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A20Q9NP91 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC6A20Q9NP91 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A20Q9NP91 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A20Q9NP91 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A20Q9NP91 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC6A20Q9NP91 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC6A20Q9NP91 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A20Q9NP91 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A20Q9NP91 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC6A20Q9NP91 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A20Q9NP91 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC6A20Q9NP91 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A20Q9NP91 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC6A20Q9NP91 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms