Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RFWD3Q6PCD5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RFWD3Q6PCD5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFWD3Q6PCD5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFWD3Q6PCD5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFWD3Q6PCD5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RFWD3Q6PCD5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RFWD3Q6PCD5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RFWD3Q6PCD5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFWD3Q6PCD5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFWD3Q6PCD5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RFWD3Q6PCD5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFWD3Q6PCD5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RFWD3Q6PCD5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFWD3Q6PCD5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFWD3Q6PCD5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFWD3Q6PCD5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFWD3Q6PCD5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFWD3Q6PCD5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFWD3Q6PCD5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFWD3Q6PCD5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RFWD3Q6PCD5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RFWD3Q6PCD5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFWD3Q6PCD5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFWD3Q6PCD5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFWD3Q6PCD5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFWD3Q6PCD5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFWD3Q6PCD5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFWD3Q6PCD5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RFWD3Q6PCD5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RFWD3Q6PCD5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RFWD3Q6PCD5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RFWD3Q6PCD5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFWD3Q6PCD5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFWD3Q6PCD5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RFWD3Q6PCD5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RFWD3Q6PCD5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFWD3Q6PCD5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RFWD3Q6PCD5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFWD3Q6PCD5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RFWD3Q6PCD5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RFWD3Q6PCD5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFWD3Q6PCD5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFWD3Q6PCD5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFWD3Q6PCD5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFWD3Q6PCD5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RFWD3Q6PCD5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RFWD3Q6PCD5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFWD3Q6PCD5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFWD3Q6PCD5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RFWD3Q6PCD5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RFWD3Q6PCD5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFWD3Q6PCD5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFWD3Q6PCD5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RFWD3Q6PCD5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RFWD3Q6PCD5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFWD3Q6PCD5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RFWD3Q6PCD5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFWD3Q6PCD5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFWD3Q6PCD5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RFWD3Q6PCD5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFWD3Q6PCD5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RFWD3Q6PCD5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFWD3Q6PCD5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RFWD3Q6PCD5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RFWD3Q6PCD5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFWD3Q6PCD5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFWD3Q6PCD5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFWD3Q6PCD5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RFWD3Q6PCD5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RFWD3Q6PCD5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RFWD3Q6PCD5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RFWD3Q6PCD5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RFWD3Q6PCD5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RFWD3Q6PCD5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RFWD3Q6PCD5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFWD3Q6PCD5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFWD3Q6PCD5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RFWD3Q6PCD5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RFWD3Q6PCD5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFWD3Q6PCD5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFWD3Q6PCD5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RFWD3Q6PCD5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RFWD3Q6PCD5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RFWD3Q6PCD5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFWD3Q6PCD5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RFWD3Q6PCD5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFWD3Q6PCD5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RFWD3Q6PCD5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFWD3Q6PCD5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFWD3Q6PCD5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RFWD3Q6PCD5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFWD3Q6PCD5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFWD3Q6PCD5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RFWD3Q6PCD5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFWD3Q6PCD5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RFWD3Q6PCD5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFWD3Q6PCD5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFWD3Q6PCD5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFWD3Q6PCD5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms