Protein–RNA interactions for Protein: H3BML4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BML4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BML4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BML4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H3BML4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H3BML4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H3BML4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BML4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BML4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BML4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BML4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BML4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BML4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BML4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BML4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BML4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BML4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H3BML4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H3BML4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H3BML4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3BML4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3BML4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3BML4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3BML4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3BML4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3BML4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3BML4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3BML4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3BML4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3BML4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
H3BML4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3BML4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3BML4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3BML4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3BML4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3BML4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BML4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BML4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BML4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BML4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BML4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BML4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BML4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BML4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BML4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BML4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BML4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BML4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BML4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BML4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BML4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BML4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BML4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BML4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BML4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BML4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BML4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BML4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
H3BML4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BML4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BML4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BML4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BML4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BML4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BML4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BML4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BML4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BML4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BML4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BML4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BML4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BML4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BML4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BML4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BML4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BML4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BML4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BML4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BML4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BML4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BML4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BML4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BML4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BML4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BML4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BML4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BML4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BML4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BML4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BML4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BML4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BML4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H3BML4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H3BML4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H3BML4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BML4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BML4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3BML4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3BML4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3BML4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3BML4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms