Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NCKIPSDQ9NZQ3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCKIPSDQ9NZQ3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCKIPSDQ9NZQ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCKIPSDQ9NZQ3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NCKIPSDQ9NZQ3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NCKIPSDQ9NZQ3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCKIPSDQ9NZQ3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCKIPSDQ9NZQ3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCKIPSDQ9NZQ3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCKIPSDQ9NZQ3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NCKIPSDQ9NZQ3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCKIPSDQ9NZQ3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NCKIPSDQ9NZQ3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCKIPSDQ9NZQ3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCKIPSDQ9NZQ3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCKIPSDQ9NZQ3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCKIPSDQ9NZQ3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NCKIPSDQ9NZQ3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCKIPSDQ9NZQ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCKIPSDQ9NZQ3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NCKIPSDQ9NZQ3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCKIPSDQ9NZQ3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCKIPSDQ9NZQ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCKIPSDQ9NZQ3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NCKIPSDQ9NZQ3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCKIPSDQ9NZQ3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCKIPSDQ9NZQ3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NCKIPSDQ9NZQ3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NCKIPSDQ9NZQ3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCKIPSDQ9NZQ3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NCKIPSDQ9NZQ3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCKIPSDQ9NZQ3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCKIPSDQ9NZQ3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCKIPSDQ9NZQ3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCKIPSDQ9NZQ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCKIPSDQ9NZQ3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCKIPSDQ9NZQ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NCKIPSDQ9NZQ3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCKIPSDQ9NZQ3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCKIPSDQ9NZQ3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCKIPSDQ9NZQ3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCKIPSDQ9NZQ3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NCKIPSDQ9NZQ3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCKIPSDQ9NZQ3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCKIPSDQ9NZQ3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCKIPSDQ9NZQ3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCKIPSDQ9NZQ3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCKIPSDQ9NZQ3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCKIPSDQ9NZQ3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCKIPSDQ9NZQ3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCKIPSDQ9NZQ3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCKIPSDQ9NZQ3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCKIPSDQ9NZQ3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCKIPSDQ9NZQ3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCKIPSDQ9NZQ3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCKIPSDQ9NZQ3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCKIPSDQ9NZQ3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCKIPSDQ9NZQ3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCKIPSDQ9NZQ3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCKIPSDQ9NZQ3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCKIPSDQ9NZQ3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCKIPSDQ9NZQ3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCKIPSDQ9NZQ3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCKIPSDQ9NZQ3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCKIPSDQ9NZQ3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCKIPSDQ9NZQ3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCKIPSDQ9NZQ3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCKIPSDQ9NZQ3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NCKIPSDQ9NZQ3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCKIPSDQ9NZQ3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCKIPSDQ9NZQ3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCKIPSDQ9NZQ3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCKIPSDQ9NZQ3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCKIPSDQ9NZQ3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCKIPSDQ9NZQ3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCKIPSDQ9NZQ3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCKIPSDQ9NZQ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCKIPSDQ9NZQ3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCKIPSDQ9NZQ3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCKIPSDQ9NZQ3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCKIPSDQ9NZQ3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCKIPSDQ9NZQ3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCKIPSDQ9NZQ3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
NCKIPSDQ9NZQ3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCKIPSDQ9NZQ3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCKIPSDQ9NZQ3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCKIPSDQ9NZQ3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCKIPSDQ9NZQ3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCKIPSDQ9NZQ3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCKIPSDQ9NZQ3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCKIPSDQ9NZQ3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms