Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYP4F12Q9HCS2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CYP4F12Q9HCS2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP4F12Q9HCS2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP4F12Q9HCS2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP4F12Q9HCS2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP4F12Q9HCS2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYP4F12Q9HCS2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP4F12Q9HCS2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYP4F12Q9HCS2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CYP4F12Q9HCS2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CYP4F12Q9HCS2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CYP4F12Q9HCS2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYP4F12Q9HCS2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4F12Q9HCS2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4F12Q9HCS2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYP4F12Q9HCS2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP4F12Q9HCS2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP4F12Q9HCS2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP4F12Q9HCS2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP4F12Q9HCS2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYP4F12Q9HCS2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP4F12Q9HCS2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP4F12Q9HCS2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYP4F12Q9HCS2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP4F12Q9HCS2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP4F12Q9HCS2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP4F12Q9HCS2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYP4F12Q9HCS2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYP4F12Q9HCS2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYP4F12Q9HCS2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP4F12Q9HCS2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CYP4F12Q9HCS2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP4F12Q9HCS2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP4F12Q9HCS2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP4F12Q9HCS2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP4F12Q9HCS2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYP4F12Q9HCS2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP4F12Q9HCS2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP4F12Q9HCS2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP4F12Q9HCS2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP4F12Q9HCS2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP4F12Q9HCS2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP4F12Q9HCS2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYP4F12Q9HCS2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYP4F12Q9HCS2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYP4F12Q9HCS2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYP4F12Q9HCS2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYP4F12Q9HCS2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP4F12Q9HCS2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYP4F12Q9HCS2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYP4F12Q9HCS2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYP4F12Q9HCS2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYP4F12Q9HCS2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYP4F12Q9HCS2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYP4F12Q9HCS2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYP4F12Q9HCS2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYP4F12Q9HCS2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYP4F12Q9HCS2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYP4F12Q9HCS2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYP4F12Q9HCS2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYP4F12Q9HCS2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYP4F12Q9HCS2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYP4F12Q9HCS2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYP4F12Q9HCS2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYP4F12Q9HCS2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYP4F12Q9HCS2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYP4F12Q9HCS2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CYP4F12Q9HCS2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYP4F12Q9HCS2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYP4F12Q9HCS2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYP4F12Q9HCS2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP4F12Q9HCS2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP4F12Q9HCS2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYP4F12Q9HCS2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP4F12Q9HCS2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP4F12Q9HCS2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP4F12Q9HCS2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP4F12Q9HCS2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP4F12Q9HCS2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYP4F12Q9HCS2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYP4F12Q9HCS2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYP4F12Q9HCS2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYP4F12Q9HCS2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYP4F12Q9HCS2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CYP4F12Q9HCS2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CYP4F12Q9HCS2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYP4F12Q9HCS2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYP4F12Q9HCS2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYP4F12Q9HCS2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CYP4F12Q9HCS2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYP4F12Q9HCS2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYP4F12Q9HCS2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYP4F12Q9HCS2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYP4F12Q9HCS2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYP4F12Q9HCS2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYP4F12Q9HCS2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms