Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC22A4Q9H015 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A4Q9H015 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A4Q9H015 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A4Q9H015 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A4Q9H015 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A4Q9H015 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A4Q9H015 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A4Q9H015 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A4Q9H015 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A4Q9H015 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A4Q9H015 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A4Q9H015 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC22A4Q9H015 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC22A4Q9H015 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC22A4Q9H015 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC22A4Q9H015 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC22A4Q9H015 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A4Q9H015 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A4Q9H015 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC22A4Q9H015 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC22A4Q9H015 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC22A4Q9H015 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC22A4Q9H015 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC22A4Q9H015 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC22A4Q9H015 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC22A4Q9H015 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC22A4Q9H015 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC22A4Q9H015 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC22A4Q9H015 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC22A4Q9H015 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC22A4Q9H015 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC22A4Q9H015 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC22A4Q9H015 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC22A4Q9H015 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC22A4Q9H015 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC22A4Q9H015 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC22A4Q9H015 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC22A4Q9H015 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SLC22A4Q9H015 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC22A4Q9H015 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC22A4Q9H015 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC22A4Q9H015 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC22A4Q9H015 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC22A4Q9H015 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC22A4Q9H015 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC22A4Q9H015 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC22A4Q9H015 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC22A4Q9H015 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC22A4Q9H015 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC22A4Q9H015 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC22A4Q9H015 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC22A4Q9H015 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC22A4Q9H015 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC22A4Q9H015 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC22A4Q9H015 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC22A4Q9H015 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A4Q9H015 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A4Q9H015 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A4Q9H015 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A4Q9H015 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A4Q9H015 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC22A4Q9H015 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC22A4Q9H015 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC22A4Q9H015 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A4Q9H015 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A4Q9H015 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A4Q9H015 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A4Q9H015 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A4Q9H015 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A4Q9H015 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A4Q9H015 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC22A4Q9H015 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A4Q9H015 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A4Q9H015 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A4Q9H015 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC22A4Q9H015 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC22A4Q9H015 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A4Q9H015 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A4Q9H015 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A4Q9H015 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A4Q9H015 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A4Q9H015 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A4Q9H015 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A4Q9H015 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A4Q9H015 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A4Q9H015 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A4Q9H015 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A4Q9H015 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A4Q9H015 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A4Q9H015 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A4Q9H015 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A4Q9H015 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A4Q9H015 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A4Q9H015 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A4Q9H015 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A4Q9H015 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A4Q9H015 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A4Q9H015 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms