Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GPR88Q9GZN0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPR88Q9GZN0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPR88Q9GZN0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPR88Q9GZN0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPR88Q9GZN0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPR88Q9GZN0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPR88Q9GZN0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GPR88Q9GZN0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPR88Q9GZN0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPR88Q9GZN0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GPR88Q9GZN0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GPR88Q9GZN0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPR88Q9GZN0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GPR88Q9GZN0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GPR88Q9GZN0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GPR88Q9GZN0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GPR88Q9GZN0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GPR88Q9GZN0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GPR88Q9GZN0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPR88Q9GZN0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPR88Q9GZN0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPR88Q9GZN0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPR88Q9GZN0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPR88Q9GZN0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPR88Q9GZN0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPR88Q9GZN0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPR88Q9GZN0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPR88Q9GZN0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPR88Q9GZN0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPR88Q9GZN0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GPR88Q9GZN0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPR88Q9GZN0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPR88Q9GZN0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPR88Q9GZN0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPR88Q9GZN0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPR88Q9GZN0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPR88Q9GZN0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GPR88Q9GZN0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPR88Q9GZN0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPR88Q9GZN0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPR88Q9GZN0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPR88Q9GZN0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPR88Q9GZN0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPR88Q9GZN0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPR88Q9GZN0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPR88Q9GZN0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPR88Q9GZN0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPR88Q9GZN0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPR88Q9GZN0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPR88Q9GZN0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPR88Q9GZN0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPR88Q9GZN0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPR88Q9GZN0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPR88Q9GZN0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPR88Q9GZN0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPR88Q9GZN0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPR88Q9GZN0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPR88Q9GZN0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPR88Q9GZN0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPR88Q9GZN0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPR88Q9GZN0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPR88Q9GZN0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPR88Q9GZN0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPR88Q9GZN0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPR88Q9GZN0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPR88Q9GZN0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPR88Q9GZN0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPR88Q9GZN0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPR88Q9GZN0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPR88Q9GZN0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GPR88Q9GZN0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPR88Q9GZN0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPR88Q9GZN0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPR88Q9GZN0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GPR88Q9GZN0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GPR88Q9GZN0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPR88Q9GZN0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPR88Q9GZN0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPR88Q9GZN0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GPR88Q9GZN0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPR88Q9GZN0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GPR88Q9GZN0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPR88Q9GZN0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPR88Q9GZN0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPR88Q9GZN0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GPR88Q9GZN0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPR88Q9GZN0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPR88Q9GZN0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPR88Q9GZN0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GPR88Q9GZN0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GPR88Q9GZN0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPR88Q9GZN0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GPR88Q9GZN0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPR88Q9GZN0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPR88Q9GZN0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPR88Q9GZN0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPR88Q9GZN0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPR88Q9GZN0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPR88Q9GZN0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms