Protein–RNA interactions for Protein: Q99728

BARD1, BRCA1-associated RING domain protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARD1Q99728 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BARD1Q99728 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BARD1Q99728 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BARD1Q99728 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BARD1Q99728 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BARD1Q99728 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BARD1Q99728 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BARD1Q99728 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BARD1Q99728 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BARD1Q99728 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BARD1Q99728 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BARD1Q99728 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BARD1Q99728 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BARD1Q99728 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BARD1Q99728 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BARD1Q99728 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BARD1Q99728 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BARD1Q99728 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BARD1Q99728 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BARD1Q99728 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BARD1Q99728 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BARD1Q99728 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BARD1Q99728 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BARD1Q99728 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BARD1Q99728 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BARD1Q99728 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BARD1Q99728 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BARD1Q99728 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BARD1Q99728 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BARD1Q99728 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BARD1Q99728 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BARD1Q99728 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BARD1Q99728 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BARD1Q99728 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BARD1Q99728 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BARD1Q99728 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BARD1Q99728 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BARD1Q99728 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BARD1Q99728 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BARD1Q99728 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BARD1Q99728 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BARD1Q99728 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BARD1Q99728 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BARD1Q99728 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BARD1Q99728 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BARD1Q99728 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BARD1Q99728 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BARD1Q99728 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BARD1Q99728 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BARD1Q99728 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BARD1Q99728 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BARD1Q99728 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BARD1Q99728 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BARD1Q99728 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BARD1Q99728 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BARD1Q99728 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BARD1Q99728 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BARD1Q99728 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BARD1Q99728 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BARD1Q99728 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BARD1Q99728 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BARD1Q99728 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BARD1Q99728 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BARD1Q99728 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BARD1Q99728 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BARD1Q99728 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BARD1Q99728 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BARD1Q99728 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BARD1Q99728 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BARD1Q99728 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BARD1Q99728 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BARD1Q99728 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BARD1Q99728 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BARD1Q99728 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BARD1Q99728 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BARD1Q99728 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BARD1Q99728 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BARD1Q99728 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BARD1Q99728 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BARD1Q99728 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BARD1Q99728 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BARD1Q99728 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BARD1Q99728 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BARD1Q99728 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BARD1Q99728 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BARD1Q99728 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BARD1Q99728 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BARD1Q99728 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARD1Q99728 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARD1Q99728 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARD1Q99728 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BARD1Q99728 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BARD1Q99728 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BARD1Q99728 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BARD1Q99728 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BARD1Q99728 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BARD1Q99728 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BARD1Q99728 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BARD1Q99728 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BARD1Q99728 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms