Protein–RNA interactions for Protein: Q92966

SNAPC3, snRNA-activating protein complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC3Q92966 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNAPC3Q92966 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNAPC3Q92966 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNAPC3Q92966 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNAPC3Q92966 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNAPC3Q92966 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNAPC3Q92966 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAPC3Q92966 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAPC3Q92966 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAPC3Q92966 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAPC3Q92966 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNAPC3Q92966 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNAPC3Q92966 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNAPC3Q92966 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAPC3Q92966 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNAPC3Q92966 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAPC3Q92966 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAPC3Q92966 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAPC3Q92966 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAPC3Q92966 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNAPC3Q92966 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNAPC3Q92966 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNAPC3Q92966 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNAPC3Q92966 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAPC3Q92966 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAPC3Q92966 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAPC3Q92966 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNAPC3Q92966 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAPC3Q92966 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAPC3Q92966 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAPC3Q92966 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAPC3Q92966 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAPC3Q92966 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAPC3Q92966 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAPC3Q92966 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAPC3Q92966 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAPC3Q92966 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAPC3Q92966 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAPC3Q92966 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAPC3Q92966 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAPC3Q92966 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SNAPC3Q92966 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAPC3Q92966 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAPC3Q92966 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAPC3Q92966 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAPC3Q92966 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAPC3Q92966 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAPC3Q92966 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAPC3Q92966 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNAPC3Q92966 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAPC3Q92966 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAPC3Q92966 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAPC3Q92966 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNAPC3Q92966 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAPC3Q92966 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAPC3Q92966 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAPC3Q92966 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNAPC3Q92966 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAPC3Q92966 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAPC3Q92966 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAPC3Q92966 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNAPC3Q92966 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNAPC3Q92966 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNAPC3Q92966 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNAPC3Q92966 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAPC3Q92966 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNAPC3Q92966 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAPC3Q92966 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAPC3Q92966 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAPC3Q92966 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNAPC3Q92966 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAPC3Q92966 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAPC3Q92966 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNAPC3Q92966 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAPC3Q92966 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNAPC3Q92966 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAPC3Q92966 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAPC3Q92966 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAPC3Q92966 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAPC3Q92966 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAPC3Q92966 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNAPC3Q92966 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAPC3Q92966 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNAPC3Q92966 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNAPC3Q92966 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAPC3Q92966 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNAPC3Q92966 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms