Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2U0

TMEM256, Transmembrane protein 256, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256Q8N2U0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM256Q8N2U0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM256Q8N2U0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM256Q8N2U0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM256Q8N2U0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM256Q8N2U0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM256Q8N2U0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM256Q8N2U0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM256Q8N2U0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM256Q8N2U0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM256Q8N2U0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM256Q8N2U0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM256Q8N2U0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM256Q8N2U0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM256Q8N2U0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM256Q8N2U0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM256Q8N2U0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM256Q8N2U0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM256Q8N2U0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM256Q8N2U0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM256Q8N2U0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM256Q8N2U0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM256Q8N2U0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM256Q8N2U0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM256Q8N2U0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM256Q8N2U0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM256Q8N2U0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM256Q8N2U0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM256Q8N2U0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM256Q8N2U0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM256Q8N2U0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM256Q8N2U0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM256Q8N2U0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM256Q8N2U0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM256Q8N2U0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM256Q8N2U0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM256Q8N2U0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM256Q8N2U0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM256Q8N2U0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM256Q8N2U0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM256Q8N2U0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM256Q8N2U0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM256Q8N2U0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM256Q8N2U0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM256Q8N2U0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM256Q8N2U0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM256Q8N2U0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM256Q8N2U0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM256Q8N2U0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM256Q8N2U0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM256Q8N2U0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM256Q8N2U0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM256Q8N2U0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM256Q8N2U0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM256Q8N2U0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM256Q8N2U0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM256Q8N2U0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM256Q8N2U0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM256Q8N2U0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM256Q8N2U0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM256Q8N2U0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM256Q8N2U0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM256Q8N2U0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM256Q8N2U0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM256Q8N2U0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM256Q8N2U0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMEM256Q8N2U0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM256Q8N2U0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM256Q8N2U0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM256Q8N2U0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM256Q8N2U0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM256Q8N2U0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM256Q8N2U0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM256Q8N2U0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM256Q8N2U0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM256Q8N2U0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM256Q8N2U0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM256Q8N2U0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM256Q8N2U0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM256Q8N2U0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM256Q8N2U0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM256Q8N2U0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM256Q8N2U0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM256Q8N2U0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM256Q8N2U0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM256Q8N2U0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM256Q8N2U0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM256Q8N2U0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM256Q8N2U0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM256Q8N2U0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM256Q8N2U0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM256Q8N2U0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM256Q8N2U0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM256Q8N2U0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM256Q8N2U0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM256Q8N2U0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM256Q8N2U0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM256Q8N2U0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM256Q8N2U0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM256Q8N2U0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms