Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMED1Q13445 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMED1Q13445 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMED1Q13445 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMED1Q13445 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMED1Q13445 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMED1Q13445 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMED1Q13445 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMED1Q13445 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMED1Q13445 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMED1Q13445 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMED1Q13445 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMED1Q13445 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMED1Q13445 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMED1Q13445 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMED1Q13445 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMED1Q13445 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMED1Q13445 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMED1Q13445 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMED1Q13445 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMED1Q13445 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMED1Q13445 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMED1Q13445 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMED1Q13445 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMED1Q13445 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMED1Q13445 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMED1Q13445 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMED1Q13445 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMED1Q13445 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMED1Q13445 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMED1Q13445 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMED1Q13445 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMED1Q13445 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMED1Q13445 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMED1Q13445 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMED1Q13445 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMED1Q13445 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMED1Q13445 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMED1Q13445 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMED1Q13445 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMED1Q13445 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMED1Q13445 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMED1Q13445 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED1Q13445 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED1Q13445 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED1Q13445 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED1Q13445 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED1Q13445 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
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