Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMNB2Q03252 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMNB2Q03252 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMNB2Q03252 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMNB2Q03252 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMNB2Q03252 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMNB2Q03252 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMNB2Q03252 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMNB2Q03252 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LMNB2Q03252 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMNB2Q03252 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMNB2Q03252 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMNB2Q03252 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMNB2Q03252 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMNB2Q03252 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMNB2Q03252 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMNB2Q03252 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMNB2Q03252 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMNB2Q03252 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMNB2Q03252 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMNB2Q03252 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMNB2Q03252 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMNB2Q03252 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMNB2Q03252 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMNB2Q03252 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMNB2Q03252 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMNB2Q03252 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMNB2Q03252 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMNB2Q03252 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMNB2Q03252 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMNB2Q03252 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMNB2Q03252 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LMNB2Q03252 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMNB2Q03252 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMNB2Q03252 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMNB2Q03252 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMNB2Q03252 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMNB2Q03252 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMNB2Q03252 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMNB2Q03252 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMNB2Q03252 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LMNB2Q03252 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMNB2Q03252 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LMNB2Q03252 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMNB2Q03252 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMNB2Q03252 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMNB2Q03252 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMNB2Q03252 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
LMNB2Q03252 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMNB2Q03252 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LMNB2Q03252 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LMNB2Q03252 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LMNB2Q03252 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMNB2Q03252 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMNB2Q03252 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LMNB2Q03252 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LMNB2Q03252 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LMNB2Q03252 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMNB2Q03252 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LMNB2Q03252 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LMNB2Q03252 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMNB2Q03252 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMNB2Q03252 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMNB2Q03252 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMNB2Q03252 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMNB2Q03252 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMNB2Q03252 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMNB2Q03252 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMNB2Q03252 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMNB2Q03252 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LMNB2Q03252 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMNB2Q03252 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMNB2Q03252 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMNB2Q03252 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMNB2Q03252 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMNB2Q03252 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LMNB2Q03252 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMNB2Q03252 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMNB2Q03252 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMNB2Q03252 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMNB2Q03252 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMNB2Q03252 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMNB2Q03252 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMNB2Q03252 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMNB2Q03252 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMNB2Q03252 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LMNB2Q03252 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMNB2Q03252 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMNB2Q03252 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LMNB2Q03252 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMNB2Q03252 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMNB2Q03252 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMNB2Q03252 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMNB2Q03252 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMNB2Q03252 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMNB2Q03252 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMNB2Q03252 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMNB2Q03252 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMNB2Q03252 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMNB2Q03252 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms