Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALDH6A1Q02252 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALDH6A1Q02252 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALDH6A1Q02252 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALDH6A1Q02252 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALDH6A1Q02252 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALDH6A1Q02252 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALDH6A1Q02252 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALDH6A1Q02252 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALDH6A1Q02252 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALDH6A1Q02252 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALDH6A1Q02252 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALDH6A1Q02252 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ALDH6A1Q02252 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALDH6A1Q02252 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALDH6A1Q02252 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALDH6A1Q02252 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALDH6A1Q02252 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALDH6A1Q02252 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALDH6A1Q02252 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALDH6A1Q02252 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALDH6A1Q02252 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALDH6A1Q02252 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALDH6A1Q02252 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALDH6A1Q02252 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH6A1Q02252 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH6A1Q02252 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH6A1Q02252 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALDH6A1Q02252 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALDH6A1Q02252 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALDH6A1Q02252 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ALDH6A1Q02252 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALDH6A1Q02252 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALDH6A1Q02252 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH6A1Q02252 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALDH6A1Q02252 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALDH6A1Q02252 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALDH6A1Q02252 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALDH6A1Q02252 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALDH6A1Q02252 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALDH6A1Q02252 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH6A1Q02252 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH6A1Q02252 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH6A1Q02252 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH6A1Q02252 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH6A1Q02252 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH6A1Q02252 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH6A1Q02252 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH6A1Q02252 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH6A1Q02252 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH6A1Q02252 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH6A1Q02252 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH6A1Q02252 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH6A1Q02252 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALDH6A1Q02252 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALDH6A1Q02252 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH6A1Q02252 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH6A1Q02252 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH6A1Q02252 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALDH6A1Q02252 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH6A1Q02252 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH6A1Q02252 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH6A1Q02252 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALDH6A1Q02252 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALDH6A1Q02252 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH6A1Q02252 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH6A1Q02252 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH6A1Q02252 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALDH6A1Q02252 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALDH6A1Q02252 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms