Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ALDH6A1Q02252 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ALDH6A1Q02252 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ALDH6A1Q02252 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ALDH6A1Q02252 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ALDH6A1Q02252 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ALDH6A1Q02252 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ALDH6A1Q02252 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ALDH6A1Q02252 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ALDH6A1Q02252 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ALDH6A1Q02252 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ALDH6A1Q02252 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ALDH6A1Q02252 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALDH6A1Q02252 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ALDH6A1Q02252 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ALDH6A1Q02252 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALDH6A1Q02252 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALDH6A1Q02252 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALDH6A1Q02252 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALDH6A1Q02252 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ALDH6A1Q02252 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALDH6A1Q02252 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALDH6A1Q02252 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALDH6A1Q02252 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALDH6A1Q02252 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ALDH6A1Q02252 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ALDH6A1Q02252 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ALDH6A1Q02252 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALDH6A1Q02252 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ALDH6A1Q02252 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALDH6A1Q02252 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALDH6A1Q02252 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ALDH6A1Q02252 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ALDH6A1Q02252 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALDH6A1Q02252 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALDH6A1Q02252 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALDH6A1Q02252 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALDH6A1Q02252 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALDH6A1Q02252 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALDH6A1Q02252 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALDH6A1Q02252 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALDH6A1Q02252 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALDH6A1Q02252 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALDH6A1Q02252 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALDH6A1Q02252 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALDH6A1Q02252 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALDH6A1Q02252 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALDH6A1Q02252 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALDH6A1Q02252 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALDH6A1Q02252 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALDH6A1Q02252 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALDH6A1Q02252 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALDH6A1Q02252 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ALDH6A1Q02252 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ALDH6A1Q02252 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALDH6A1Q02252 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALDH6A1Q02252 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALDH6A1Q02252 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ALDH6A1Q02252 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALDH6A1Q02252 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALDH6A1Q02252 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ALDH6A1Q02252 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALDH6A1Q02252 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALDH6A1Q02252 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALDH6A1Q02252 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALDH6A1Q02252 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALDH6A1Q02252 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALDH6A1Q02252 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALDH6A1Q02252 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALDH6A1Q02252 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALDH6A1Q02252 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALDH6A1Q02252 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALDH6A1Q02252 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALDH6A1Q02252 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALDH6A1Q02252 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALDH6A1Q02252 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ALDH6A1Q02252 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALDH6A1Q02252 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALDH6A1Q02252 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALDH6A1Q02252 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALDH6A1Q02252 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALDH6A1Q02252 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALDH6A1Q02252 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALDH6A1Q02252 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALDH6A1Q02252 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALDH6A1Q02252 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ALDH6A1Q02252 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALDH6A1Q02252 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALDH6A1Q02252 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALDH6A1Q02252 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALDH6A1Q02252 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALDH6A1Q02252 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALDH6A1Q02252 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALDH6A1Q02252 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALDH6A1Q02252 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALDH6A1Q02252 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALDH6A1Q02252 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALDH6A1Q02252 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALDH6A1Q02252 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ALDH6A1Q02252 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms