Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAMP11215 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAMP11215 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAMP11215 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAMP11215 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAMP11215 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAMP11215 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAMP11215 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAMP11215 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAMP11215 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAMP11215 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAMP11215 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAMP11215 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAMP11215 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAMP11215 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAMP11215 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITGAMP11215 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGAMP11215 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAMP11215 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGAMP11215 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAMP11215 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGAMP11215 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAMP11215 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAMP11215 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGAMP11215 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAMP11215 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAMP11215 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGAMP11215 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAMP11215 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAMP11215 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGAMP11215 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAMP11215 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAMP11215 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAMP11215 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGAMP11215 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAMP11215 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAMP11215 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAMP11215 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAMP11215 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGAMP11215 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAMP11215 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAMP11215 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAMP11215 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAMP11215 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGAMP11215 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAMP11215 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAMP11215 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAMP11215 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAMP11215 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGAMP11215 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAMP11215 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAMP11215 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAMP11215 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAMP11215 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAMP11215 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ITGAMP11215 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAMP11215 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAMP11215 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAMP11215 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAMP11215 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAMP11215 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAMP11215 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAMP11215 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAMP11215 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAMP11215 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAMP11215 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAMP11215 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAMP11215 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAMP11215 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAMP11215 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAMP11215 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAMP11215 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAMP11215 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAMP11215 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAMP11215 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAMP11215 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAMP11215 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAMP11215 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAMP11215 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAMP11215 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAMP11215 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAMP11215 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAMP11215 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAMP11215 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAMP11215 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAMP11215 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAMP11215 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAMP11215 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAMP11215 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAMP11215 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAMP11215 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAMP11215 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAMP11215 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms