Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF40O75150 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF40O75150 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF40O75150 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF40O75150 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF40O75150 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF40O75150 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF40O75150 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF40O75150 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF40O75150 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF40O75150 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF40O75150 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF40O75150 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF40O75150 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF40O75150 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF40O75150 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF40O75150 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF40O75150 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF40O75150 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF40O75150 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF40O75150 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF40O75150 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF40O75150 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF40O75150 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF40O75150 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF40O75150 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF40O75150 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF40O75150 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF40O75150 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF40O75150 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF40O75150 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF40O75150 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF40O75150 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF40O75150 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF40O75150 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF40O75150 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF40O75150 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF40O75150 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF40O75150 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF40O75150 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF40O75150 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF40O75150 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF40O75150 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF40O75150 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF40O75150 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF40O75150 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF40O75150 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF40O75150 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF40O75150 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF40O75150 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF40O75150 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RNF40O75150 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF40O75150 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF40O75150 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF40O75150 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF40O75150 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF40O75150 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF40O75150 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF40O75150 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF40O75150 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF40O75150 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF40O75150 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF40O75150 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF40O75150 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF40O75150 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF40O75150 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF40O75150 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF40O75150 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF40O75150 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF40O75150 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF40O75150 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF40O75150 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF40O75150 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF40O75150 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF40O75150 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF40O75150 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF40O75150 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF40O75150 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF40O75150 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF40O75150 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF40O75150 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF40O75150 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF40O75150 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF40O75150 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF40O75150 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF40O75150 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF40O75150 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF40O75150 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF40O75150 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF40O75150 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF40O75150 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF40O75150 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF40O75150 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF40O75150 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF40O75150 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF40O75150 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF40O75150 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF40O75150 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF40O75150 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF40O75150 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms