Protein–RNA interactions for Protein: O60890

OPHN1, Oligophrenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPHN1O60890 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OPHN1O60890 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
OPHN1O60890 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
OPHN1O60890 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
OPHN1O60890 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
OPHN1O60890 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
OPHN1O60890 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
OPHN1O60890 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
OPHN1O60890 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
OPHN1O60890 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
OPHN1O60890 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
OPHN1O60890 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
OPHN1O60890 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
OPHN1O60890 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
OPHN1O60890 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
OPHN1O60890 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
OPHN1O60890 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
OPHN1O60890 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
OPHN1O60890 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OPHN1O60890 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OPHN1O60890 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
OPHN1O60890 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OPHN1O60890 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OPHN1O60890 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
OPHN1O60890 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OPHN1O60890 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OPHN1O60890 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
OPHN1O60890 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
OPHN1O60890 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
OPHN1O60890 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
OPHN1O60890 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
OPHN1O60890 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
OPHN1O60890 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
OPHN1O60890 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OPHN1O60890 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OPHN1O60890 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OPHN1O60890 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OPHN1O60890 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OPHN1O60890 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OPHN1O60890 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
OPHN1O60890 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OPHN1O60890 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OPHN1O60890 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OPHN1O60890 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OPHN1O60890 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OPHN1O60890 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
OPHN1O60890 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
OPHN1O60890 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
OPHN1O60890 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OPHN1O60890 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
OPHN1O60890 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
OPHN1O60890 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OPHN1O60890 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OPHN1O60890 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
OPHN1O60890 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
OPHN1O60890 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
OPHN1O60890 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OPHN1O60890 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
OPHN1O60890 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OPHN1O60890 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OPHN1O60890 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
OPHN1O60890 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
OPHN1O60890 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
OPHN1O60890 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
OPHN1O60890 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
OPHN1O60890 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
OPHN1O60890 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
OPHN1O60890 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
OPHN1O60890 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
OPHN1O60890 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
OPHN1O60890 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OPHN1O60890 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
OPHN1O60890 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OPHN1O60890 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OPHN1O60890 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OPHN1O60890 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
OPHN1O60890 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
OPHN1O60890 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
OPHN1O60890 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
OPHN1O60890 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
OPHN1O60890 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
OPHN1O60890 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OPHN1O60890 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
OPHN1O60890 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OPHN1O60890 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
OPHN1O60890 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OPHN1O60890 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
OPHN1O60890 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OPHN1O60890 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OPHN1O60890 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OPHN1O60890 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OPHN1O60890 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
OPHN1O60890 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
OPHN1O60890 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
OPHN1O60890 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
OPHN1O60890 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
OPHN1O60890 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
OPHN1O60890 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
OPHN1O60890 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
OPHN1O60890 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms