Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX2O60749 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX2O60749 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX2O60749 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX2O60749 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX2O60749 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX2O60749 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX2O60749 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX2O60749 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX2O60749 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX2O60749 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX2O60749 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX2O60749 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX2O60749 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX2O60749 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX2O60749 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX2O60749 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX2O60749 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX2O60749 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX2O60749 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX2O60749 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX2O60749 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX2O60749 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX2O60749 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX2O60749 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX2O60749 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX2O60749 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX2O60749 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX2O60749 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX2O60749 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX2O60749 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX2O60749 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX2O60749 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX2O60749 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX2O60749 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX2O60749 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX2O60749 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX2O60749 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX2O60749 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX2O60749 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX2O60749 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SNX2O60749 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX2O60749 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX2O60749 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX2O60749 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX2O60749 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX2O60749 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX2O60749 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX2O60749 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX2O60749 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX2O60749 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX2O60749 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX2O60749 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX2O60749 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX2O60749 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX2O60749 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX2O60749 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX2O60749 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX2O60749 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX2O60749 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SNX2O60749 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX2O60749 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX2O60749 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX2O60749 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX2O60749 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX2O60749 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX2O60749 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX2O60749 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX2O60749 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX2O60749 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX2O60749 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX2O60749 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX2O60749 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX2O60749 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX2O60749 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX2O60749 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX2O60749 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX2O60749 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX2O60749 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX2O60749 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX2O60749 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX2O60749 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX2O60749 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX2O60749 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX2O60749 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX2O60749 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX2O60749 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX2O60749 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX2O60749 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX2O60749 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX2O60749 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX2O60749 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX2O60749 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX2O60749 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX2O60749 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX2O60749 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX2O60749 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX2O60749 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX2O60749 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX2O60749 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms