Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SNX2O60749 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SNX2O60749 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SNX2O60749 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SNX2O60749 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SNX2O60749 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SNX2O60749 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SNX2O60749 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SNX2O60749 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SNX2O60749 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SNX2O60749 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
SNX2O60749 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SNX2O60749 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SNX2O60749 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SNX2O60749 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SNX2O60749 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SNX2O60749 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SNX2O60749 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SNX2O60749 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SNX2O60749 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SNX2O60749 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SNX2O60749 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SNX2O60749 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SNX2O60749 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SNX2O60749 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SNX2O60749 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SNX2O60749 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SNX2O60749 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SNX2O60749 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SNX2O60749 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SNX2O60749 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SNX2O60749 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SNX2O60749 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SNX2O60749 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
SNX2O60749 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SNX2O60749 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SNX2O60749 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SNX2O60749 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SNX2O60749 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SNX2O60749 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SNX2O60749 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SNX2O60749 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SNX2O60749 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SNX2O60749 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SNX2O60749 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SNX2O60749 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SNX2O60749 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SNX2O60749 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SNX2O60749 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SNX2O60749 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNX2O60749 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNX2O60749 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SNX2O60749 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SNX2O60749 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNX2O60749 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SNX2O60749 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SNX2O60749 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SNX2O60749 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNX2O60749 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SNX2O60749 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SNX2O60749 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SNX2O60749 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNX2O60749 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNX2O60749 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNX2O60749 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SNX2O60749 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SNX2O60749 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SNX2O60749 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SNX2O60749 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNX2O60749 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SNX2O60749 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SNX2O60749 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNX2O60749 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SNX2O60749 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SNX2O60749 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNX2O60749 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNX2O60749 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNX2O60749 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SNX2O60749 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNX2O60749 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNX2O60749 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNX2O60749 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNX2O60749 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SNX2O60749 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNX2O60749 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNX2O60749 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SNX2O60749 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNX2O60749 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX2O60749 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNX2O60749 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNX2O60749 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNX2O60749 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNX2O60749 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNX2O60749 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNX2O60749 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNX2O60749 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SNX2O60749 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SNX2O60749 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNX2O60749 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNX2O60749 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250.3 ms