Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TBX1O43435 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBX1O43435 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBX1O43435 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBX1O43435 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX1O43435 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX1O43435 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBX1O43435 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX1O43435 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX1O43435 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX1O43435 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBX1O43435 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX1O43435 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX1O43435 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBX1O43435 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBX1O43435 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBX1O43435 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBX1O43435 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TBX1O43435 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBX1O43435 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBX1O43435 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBX1O43435 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBX1O43435 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBX1O43435 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TBX1O43435 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBX1O43435 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBX1O43435 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBX1O43435 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TBX1O43435 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TBX1O43435 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TBX1O43435 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TBX1O43435 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TBX1O43435 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TBX1O43435 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TBX1O43435 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TBX1O43435 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TBX1O43435 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TBX1O43435 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TBX1O43435 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TBX1O43435 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TBX1O43435 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TBX1O43435 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TBX1O43435 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TBX1O43435 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TBX1O43435 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TBX1O43435 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBX1O43435 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBX1O43435 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBX1O43435 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBX1O43435 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TBX1O43435 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TBX1O43435 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TBX1O43435 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TBX1O43435 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TBX1O43435 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TBX1O43435 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TBX1O43435 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TBX1O43435 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TBX1O43435 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBX1O43435 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBX1O43435 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBX1O43435 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TBX1O43435 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBX1O43435 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBX1O43435 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBX1O43435 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TBX1O43435 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TBX1O43435 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBX1O43435 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBX1O43435 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBX1O43435 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBX1O43435 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TBX1O43435 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBX1O43435 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBX1O43435 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TBX1O43435 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBX1O43435 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBX1O43435 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBX1O43435 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBX1O43435 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TBX1O43435 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBX1O43435 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBX1O43435 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBX1O43435 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TBX1O43435 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TBX1O43435 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TBX1O43435 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TBX1O43435 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TBX1O43435 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TBX1O43435 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TBX1O43435 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TBX1O43435 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBX1O43435 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBX1O43435 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TBX1O43435 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TBX1O43435 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TBX1O43435 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TBX1O43435 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBX1O43435 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TBX1O43435 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms