Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC1Q9Y5R8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC1Q9Y5R8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC1Q9Y5R8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC1Q9Y5R8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC1Q9Y5R8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC1Q9Y5R8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC1Q9Y5R8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAPPC1Q9Y5R8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAPPC1Q9Y5R8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC1Q9Y5R8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAPPC1Q9Y5R8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAPPC1Q9Y5R8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC1Q9Y5R8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC1Q9Y5R8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC1Q9Y5R8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC1Q9Y5R8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC1Q9Y5R8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC1Q9Y5R8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAPPC1Q9Y5R8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC1Q9Y5R8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC1Q9Y5R8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC1Q9Y5R8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC1Q9Y5R8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC1Q9Y5R8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC1Q9Y5R8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC1Q9Y5R8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC1Q9Y5R8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC1Q9Y5R8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC1Q9Y5R8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC1Q9Y5R8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC1Q9Y5R8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC1Q9Y5R8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC1Q9Y5R8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC1Q9Y5R8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC1Q9Y5R8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC1Q9Y5R8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC1Q9Y5R8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC1Q9Y5R8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC1Q9Y5R8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC1Q9Y5R8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC1Q9Y5R8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC1Q9Y5R8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC1Q9Y5R8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC1Q9Y5R8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC1Q9Y5R8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC1Q9Y5R8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC1Q9Y5R8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC1Q9Y5R8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC1Q9Y5R8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC1Q9Y5R8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC1Q9Y5R8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC1Q9Y5R8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC1Q9Y5R8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC1Q9Y5R8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC1Q9Y5R8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC1Q9Y5R8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC1Q9Y5R8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC1Q9Y5R8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC1Q9Y5R8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC1Q9Y5R8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC1Q9Y5R8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC1Q9Y5R8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC1Q9Y5R8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC1Q9Y5R8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC1Q9Y5R8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC1Q9Y5R8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC1Q9Y5R8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC1Q9Y5R8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC1Q9Y5R8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC1Q9Y5R8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC1Q9Y5R8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC1Q9Y5R8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC1Q9Y5R8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC1Q9Y5R8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC1Q9Y5R8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC1Q9Y5R8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC1Q9Y5R8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC1Q9Y5R8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC1Q9Y5R8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC1Q9Y5R8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC1Q9Y5R8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms