Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HPS5Q9UPZ3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HPS5Q9UPZ3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HPS5Q9UPZ3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HPS5Q9UPZ3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HPS5Q9UPZ3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HPS5Q9UPZ3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HPS5Q9UPZ3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HPS5Q9UPZ3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HPS5Q9UPZ3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HPS5Q9UPZ3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
HPS5Q9UPZ3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
HPS5Q9UPZ3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HPS5Q9UPZ3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HPS5Q9UPZ3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HPS5Q9UPZ3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HPS5Q9UPZ3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HPS5Q9UPZ3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HPS5Q9UPZ3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HPS5Q9UPZ3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
HPS5Q9UPZ3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
HPS5Q9UPZ3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
HPS5Q9UPZ3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HPS5Q9UPZ3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HPS5Q9UPZ3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HPS5Q9UPZ3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HPS5Q9UPZ3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HPS5Q9UPZ3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HPS5Q9UPZ3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
HPS5Q9UPZ3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HPS5Q9UPZ3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HPS5Q9UPZ3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
HPS5Q9UPZ3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
HPS5Q9UPZ3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
HPS5Q9UPZ3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
HPS5Q9UPZ3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
HPS5Q9UPZ3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HPS5Q9UPZ3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HPS5Q9UPZ3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HPS5Q9UPZ3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HPS5Q9UPZ3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
HPS5Q9UPZ3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
HPS5Q9UPZ3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
HPS5Q9UPZ3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
HPS5Q9UPZ3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
HPS5Q9UPZ3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
HPS5Q9UPZ3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
HPS5Q9UPZ3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
HPS5Q9UPZ3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
HPS5Q9UPZ3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
HPS5Q9UPZ3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
HPS5Q9UPZ3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
HPS5Q9UPZ3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
HPS5Q9UPZ3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
HPS5Q9UPZ3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HPS5Q9UPZ3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
HPS5Q9UPZ3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
HPS5Q9UPZ3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
HPS5Q9UPZ3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
HPS5Q9UPZ3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
HPS5Q9UPZ3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
HPS5Q9UPZ3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HPS5Q9UPZ3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HPS5Q9UPZ3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
HPS5Q9UPZ3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
HPS5Q9UPZ3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
HPS5Q9UPZ3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
HPS5Q9UPZ3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
HPS5Q9UPZ3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
HPS5Q9UPZ3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
HPS5Q9UPZ3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
HPS5Q9UPZ3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HPS5Q9UPZ3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
HPS5Q9UPZ3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HPS5Q9UPZ3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HPS5Q9UPZ3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HPS5Q9UPZ3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HPS5Q9UPZ3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
HPS5Q9UPZ3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
HPS5Q9UPZ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
HPS5Q9UPZ3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HPS5Q9UPZ3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
HPS5Q9UPZ3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HPS5Q9UPZ3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
HPS5Q9UPZ3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HPS5Q9UPZ3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
HPS5Q9UPZ3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HPS5Q9UPZ3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
HPS5Q9UPZ3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
HPS5Q9UPZ3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HPS5Q9UPZ3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
HPS5Q9UPZ3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
HPS5Q9UPZ3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
HPS5Q9UPZ3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
HPS5Q9UPZ3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
HPS5Q9UPZ3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HPS5Q9UPZ3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
HPS5Q9UPZ3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HPS5Q9UPZ3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
HPS5Q9UPZ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms