Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
HPS5Q9UPZ3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.86■■■■□ 3.97
HPS5Q9UPZ3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
HPS5Q9UPZ3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
HPS5Q9UPZ3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
HPS5Q9UPZ3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
HPS5Q9UPZ3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
HPS5Q9UPZ3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
HPS5Q9UPZ3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
HPS5Q9UPZ3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
HPS5Q9UPZ3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
HPS5Q9UPZ3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
HPS5Q9UPZ3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
HPS5Q9UPZ3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
HPS5Q9UPZ3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
HPS5Q9UPZ3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
HPS5Q9UPZ3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
HPS5Q9UPZ3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
HPS5Q9UPZ3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
HPS5Q9UPZ3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
HPS5Q9UPZ3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
HPS5Q9UPZ3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
HPS5Q9UPZ3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
HPS5Q9UPZ3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
HPS5Q9UPZ3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
HPS5Q9UPZ3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
HPS5Q9UPZ3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
HPS5Q9UPZ3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
HPS5Q9UPZ3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
HPS5Q9UPZ3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
HPS5Q9UPZ3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
HPS5Q9UPZ3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
HPS5Q9UPZ3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
HPS5Q9UPZ3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
HPS5Q9UPZ3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
HPS5Q9UPZ3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
HPS5Q9UPZ3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
HPS5Q9UPZ3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
HPS5Q9UPZ3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
HPS5Q9UPZ3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
HPS5Q9UPZ3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
HPS5Q9UPZ3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
HPS5Q9UPZ3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
HPS5Q9UPZ3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
HPS5Q9UPZ3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
HPS5Q9UPZ3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
HPS5Q9UPZ3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
HPS5Q9UPZ3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
HPS5Q9UPZ3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
HPS5Q9UPZ3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
HPS5Q9UPZ3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
HPS5Q9UPZ3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
HPS5Q9UPZ3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
HPS5Q9UPZ3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
HPS5Q9UPZ3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
HPS5Q9UPZ3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
HPS5Q9UPZ3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
HPS5Q9UPZ3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
HPS5Q9UPZ3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
HPS5Q9UPZ3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
HPS5Q9UPZ3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
HPS5Q9UPZ3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
HPS5Q9UPZ3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
HPS5Q9UPZ3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
HPS5Q9UPZ3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
HPS5Q9UPZ3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
HPS5Q9UPZ3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
HPS5Q9UPZ3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
HPS5Q9UPZ3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
HPS5Q9UPZ3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
HPS5Q9UPZ3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
HPS5Q9UPZ3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
HPS5Q9UPZ3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
HPS5Q9UPZ3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HPS5Q9UPZ3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HPS5Q9UPZ3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
HPS5Q9UPZ3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
HPS5Q9UPZ3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
HPS5Q9UPZ3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
HPS5Q9UPZ3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
HPS5Q9UPZ3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
HPS5Q9UPZ3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
HPS5Q9UPZ3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
HPS5Q9UPZ3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
HPS5Q9UPZ3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
HPS5Q9UPZ3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
HPS5Q9UPZ3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
HPS5Q9UPZ3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
HPS5Q9UPZ3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
HPS5Q9UPZ3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
HPS5Q9UPZ3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
HPS5Q9UPZ3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
HPS5Q9UPZ3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
HPS5Q9UPZ3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
HPS5Q9UPZ3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
HPS5Q9UPZ3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
HPS5Q9UPZ3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
HPS5Q9UPZ3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
HPS5Q9UPZ3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
HPS5Q9UPZ3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms