Protein–RNA interactions for Protein: Q9UND3

NPIPA1, Nuclear pore complex-interacting protein family member A1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA1Q9UND3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPIPA1Q9UND3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPIPA1Q9UND3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPIPA1Q9UND3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPIPA1Q9UND3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPIPA1Q9UND3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPA1Q9UND3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPA1Q9UND3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPA1Q9UND3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPA1Q9UND3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPIPA1Q9UND3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPIPA1Q9UND3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPIPA1Q9UND3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPIPA1Q9UND3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPIPA1Q9UND3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPIPA1Q9UND3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPIPA1Q9UND3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPIPA1Q9UND3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPA1Q9UND3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPA1Q9UND3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPA1Q9UND3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPA1Q9UND3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPA1Q9UND3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPA1Q9UND3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPIPA1Q9UND3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPIPA1Q9UND3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPA1Q9UND3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPA1Q9UND3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPA1Q9UND3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPIPA1Q9UND3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPIPA1Q9UND3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPIPA1Q9UND3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPIPA1Q9UND3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPIPA1Q9UND3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPIPA1Q9UND3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPIPA1Q9UND3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPIPA1Q9UND3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPIPA1Q9UND3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPIPA1Q9UND3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPIPA1Q9UND3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPIPA1Q9UND3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPIPA1Q9UND3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPIPA1Q9UND3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPIPA1Q9UND3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPIPA1Q9UND3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPIPA1Q9UND3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPIPA1Q9UND3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NPIPA1Q9UND3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPIPA1Q9UND3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPIPA1Q9UND3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPIPA1Q9UND3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPIPA1Q9UND3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPIPA1Q9UND3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPIPA1Q9UND3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPIPA1Q9UND3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPIPA1Q9UND3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPIPA1Q9UND3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPIPA1Q9UND3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPIPA1Q9UND3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPIPA1Q9UND3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPIPA1Q9UND3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPIPA1Q9UND3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NPIPA1Q9UND3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPIPA1Q9UND3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPIPA1Q9UND3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NPIPA1Q9UND3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPIPA1Q9UND3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPIPA1Q9UND3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPIPA1Q9UND3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPIPA1Q9UND3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPIPA1Q9UND3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPIPA1Q9UND3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPIPA1Q9UND3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPIPA1Q9UND3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPIPA1Q9UND3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPA1Q9UND3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPA1Q9UND3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPA1Q9UND3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPA1Q9UND3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPA1Q9UND3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPIPA1Q9UND3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPIPA1Q9UND3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPIPA1Q9UND3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPIPA1Q9UND3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPIPA1Q9UND3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPIPA1Q9UND3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPIPA1Q9UND3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPIPA1Q9UND3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPIPA1Q9UND3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NPIPA1Q9UND3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NPIPA1Q9UND3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPIPA1Q9UND3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPIPA1Q9UND3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPIPA1Q9UND3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPIPA1Q9UND3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPIPA1Q9UND3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPIPA1Q9UND3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPIPA1Q9UND3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPIPA1Q9UND3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPIPA1Q9UND3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms