Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC13A4Q9UKG4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC13A4Q9UKG4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC13A4Q9UKG4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC13A4Q9UKG4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC13A4Q9UKG4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC13A4Q9UKG4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC13A4Q9UKG4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC13A4Q9UKG4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC13A4Q9UKG4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC13A4Q9UKG4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC13A4Q9UKG4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC13A4Q9UKG4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC13A4Q9UKG4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC13A4Q9UKG4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC13A4Q9UKG4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC13A4Q9UKG4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC13A4Q9UKG4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC13A4Q9UKG4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC13A4Q9UKG4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC13A4Q9UKG4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC13A4Q9UKG4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC13A4Q9UKG4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC13A4Q9UKG4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC13A4Q9UKG4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC13A4Q9UKG4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC13A4Q9UKG4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC13A4Q9UKG4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC13A4Q9UKG4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC13A4Q9UKG4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC13A4Q9UKG4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC13A4Q9UKG4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC13A4Q9UKG4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC13A4Q9UKG4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC13A4Q9UKG4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC13A4Q9UKG4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC13A4Q9UKG4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC13A4Q9UKG4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC13A4Q9UKG4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC13A4Q9UKG4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC13A4Q9UKG4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC13A4Q9UKG4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC13A4Q9UKG4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC13A4Q9UKG4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC13A4Q9UKG4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC13A4Q9UKG4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC13A4Q9UKG4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC13A4Q9UKG4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC13A4Q9UKG4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC13A4Q9UKG4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC13A4Q9UKG4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC13A4Q9UKG4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC13A4Q9UKG4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC13A4Q9UKG4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC13A4Q9UKG4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC13A4Q9UKG4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC13A4Q9UKG4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC13A4Q9UKG4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC13A4Q9UKG4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC13A4Q9UKG4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC13A4Q9UKG4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC13A4Q9UKG4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC13A4Q9UKG4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC13A4Q9UKG4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC13A4Q9UKG4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC13A4Q9UKG4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC13A4Q9UKG4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC13A4Q9UKG4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC13A4Q9UKG4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC13A4Q9UKG4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC13A4Q9UKG4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC13A4Q9UKG4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC13A4Q9UKG4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC13A4Q9UKG4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC13A4Q9UKG4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC13A4Q9UKG4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC13A4Q9UKG4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC13A4Q9UKG4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC13A4Q9UKG4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC13A4Q9UKG4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC13A4Q9UKG4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC13A4Q9UKG4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC13A4Q9UKG4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC13A4Q9UKG4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC13A4Q9UKG4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC13A4Q9UKG4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC13A4Q9UKG4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC13A4Q9UKG4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC13A4Q9UKG4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC13A4Q9UKG4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC13A4Q9UKG4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC13A4Q9UKG4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC13A4Q9UKG4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC13A4Q9UKG4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC13A4Q9UKG4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC13A4Q9UKG4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC13A4Q9UKG4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC13A4Q9UKG4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC13A4Q9UKG4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC13A4Q9UKG4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms