Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVK-18Q9QC07 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-18Q9QC07 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVK-18Q9QC07 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVK-18Q9QC07 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-18Q9QC07 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-18Q9QC07 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-18Q9QC07 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVK-18Q9QC07 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-18Q9QC07 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVK-18Q9QC07 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-18Q9QC07 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-18Q9QC07 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-18Q9QC07 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVK-18Q9QC07 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-18Q9QC07 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-18Q9QC07 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-18Q9QC07 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVK-18Q9QC07 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-18Q9QC07 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-18Q9QC07 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-18Q9QC07 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVK-18Q9QC07 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-18Q9QC07 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-18Q9QC07 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-18Q9QC07 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-18Q9QC07 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-18Q9QC07 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-18Q9QC07 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-18Q9QC07 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-18Q9QC07 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-18Q9QC07 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-18Q9QC07 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-18Q9QC07 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-18Q9QC07 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-18Q9QC07 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-18Q9QC07 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-18Q9QC07 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-18Q9QC07 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-18Q9QC07 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVK-18Q9QC07 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-18Q9QC07 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-18Q9QC07 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-18Q9QC07 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-18Q9QC07 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVK-18Q9QC07 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVK-18Q9QC07 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERVK-18Q9QC07 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-18Q9QC07 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVK-18Q9QC07 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVK-18Q9QC07 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVK-18Q9QC07 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVK-18Q9QC07 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVK-18Q9QC07 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVK-18Q9QC07 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVK-18Q9QC07 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVK-18Q9QC07 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVK-18Q9QC07 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVK-18Q9QC07 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVK-18Q9QC07 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVK-18Q9QC07 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVK-18Q9QC07 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVK-18Q9QC07 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVK-18Q9QC07 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVK-18Q9QC07 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVK-18Q9QC07 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVK-18Q9QC07 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVK-18Q9QC07 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-18Q9QC07 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVK-18Q9QC07 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVK-18Q9QC07 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-18Q9QC07 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-18Q9QC07 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVK-18Q9QC07 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms