Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAP2Q9NVZ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAP2Q9NVZ3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NECAP2Q9NVZ3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECAP2Q9NVZ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NECAP2Q9NVZ3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECAP2Q9NVZ3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NECAP2Q9NVZ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECAP2Q9NVZ3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECAP2Q9NVZ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECAP2Q9NVZ3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NECAP2Q9NVZ3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECAP2Q9NVZ3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NECAP2Q9NVZ3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECAP2Q9NVZ3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECAP2Q9NVZ3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NECAP2Q9NVZ3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAP2Q9NVZ3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAP2Q9NVZ3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAP2Q9NVZ3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAP2Q9NVZ3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NECAP2Q9NVZ3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NECAP2Q9NVZ3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NECAP2Q9NVZ3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAP2Q9NVZ3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAP2Q9NVZ3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAP2Q9NVZ3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAP2Q9NVZ3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NECAP2Q9NVZ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NECAP2Q9NVZ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECAP2Q9NVZ3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NECAP2Q9NVZ3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECAP2Q9NVZ3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECAP2Q9NVZ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NECAP2Q9NVZ3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECAP2Q9NVZ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECAP2Q9NVZ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NECAP2Q9NVZ3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NECAP2Q9NVZ3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NECAP2Q9NVZ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NECAP2Q9NVZ3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NECAP2Q9NVZ3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECAP2Q9NVZ3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NECAP2Q9NVZ3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECAP2Q9NVZ3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECAP2Q9NVZ3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECAP2Q9NVZ3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECAP2Q9NVZ3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECAP2Q9NVZ3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NECAP2Q9NVZ3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NECAP2Q9NVZ3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECAP2Q9NVZ3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECAP2Q9NVZ3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NECAP2Q9NVZ3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECAP2Q9NVZ3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NECAP2Q9NVZ3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NECAP2Q9NVZ3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NECAP2Q9NVZ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECAP2Q9NVZ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECAP2Q9NVZ3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECAP2Q9NVZ3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECAP2Q9NVZ3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECAP2Q9NVZ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECAP2Q9NVZ3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECAP2Q9NVZ3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECAP2Q9NVZ3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECAP2Q9NVZ3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECAP2Q9NVZ3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NECAP2Q9NVZ3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECAP2Q9NVZ3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECAP2Q9NVZ3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NECAP2Q9NVZ3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECAP2Q9NVZ3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECAP2Q9NVZ3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECAP2Q9NVZ3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms