Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFRSF19Q9NS68 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF19Q9NS68 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF19Q9NS68 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFRSF19Q9NS68 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF19Q9NS68 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFRSF19Q9NS68 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF19Q9NS68 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF19Q9NS68 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFRSF19Q9NS68 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF19Q9NS68 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFRSF19Q9NS68 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF19Q9NS68 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF19Q9NS68 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF19Q9NS68 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFRSF19Q9NS68 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF19Q9NS68 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF19Q9NS68 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF19Q9NS68 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF19Q9NS68 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF19Q9NS68 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFRSF19Q9NS68 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF19Q9NS68 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF19Q9NS68 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF19Q9NS68 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF19Q9NS68 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF19Q9NS68 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF19Q9NS68 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TNFRSF19Q9NS68 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFRSF19Q9NS68 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFRSF19Q9NS68 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFRSF19Q9NS68 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFRSF19Q9NS68 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF19Q9NS68 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFRSF19Q9NS68 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF19Q9NS68 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFRSF19Q9NS68 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF19Q9NS68 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF19Q9NS68 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF19Q9NS68 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF19Q9NS68 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFRSF19Q9NS68 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF19Q9NS68 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF19Q9NS68 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF19Q9NS68 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFRSF19Q9NS68 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF19Q9NS68 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF19Q9NS68 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFRSF19Q9NS68 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF19Q9NS68 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFRSF19Q9NS68 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF19Q9NS68 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF19Q9NS68 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF19Q9NS68 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF19Q9NS68 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF19Q9NS68 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFRSF19Q9NS68 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF19Q9NS68 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF19Q9NS68 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFRSF19Q9NS68 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFRSF19Q9NS68 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFRSF19Q9NS68 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF19Q9NS68 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF19Q9NS68 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF19Q9NS68 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF19Q9NS68 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFRSF19Q9NS68 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF19Q9NS68 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF19Q9NS68 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF19Q9NS68 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF19Q9NS68 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF19Q9NS68 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF19Q9NS68 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms