Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSU72Q9NP77 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSU72Q9NP77 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSU72Q9NP77 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSU72Q9NP77 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSU72Q9NP77 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSU72Q9NP77 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSU72Q9NP77 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSU72Q9NP77 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSU72Q9NP77 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSU72Q9NP77 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSU72Q9NP77 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSU72Q9NP77 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSU72Q9NP77 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSU72Q9NP77 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSU72Q9NP77 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SSU72Q9NP77 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SSU72Q9NP77 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSU72Q9NP77 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSU72Q9NP77 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSU72Q9NP77 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSU72Q9NP77 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSU72Q9NP77 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSU72Q9NP77 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSU72Q9NP77 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSU72Q9NP77 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSU72Q9NP77 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSU72Q9NP77 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSU72Q9NP77 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSU72Q9NP77 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSU72Q9NP77 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSU72Q9NP77 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSU72Q9NP77 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSU72Q9NP77 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSU72Q9NP77 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSU72Q9NP77 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSU72Q9NP77 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSU72Q9NP77 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSU72Q9NP77 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSU72Q9NP77 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSU72Q9NP77 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSU72Q9NP77 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSU72Q9NP77 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSU72Q9NP77 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSU72Q9NP77 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSU72Q9NP77 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSU72Q9NP77 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSU72Q9NP77 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSU72Q9NP77 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSU72Q9NP77 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSU72Q9NP77 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSU72Q9NP77 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SSU72Q9NP77 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SSU72Q9NP77 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SSU72Q9NP77 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSU72Q9NP77 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SSU72Q9NP77 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSU72Q9NP77 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SSU72Q9NP77 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SSU72Q9NP77 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SSU72Q9NP77 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSU72Q9NP77 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SSU72Q9NP77 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSU72Q9NP77 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SSU72Q9NP77 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSU72Q9NP77 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SSU72Q9NP77 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SSU72Q9NP77 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SSU72Q9NP77 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SSU72Q9NP77 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SSU72Q9NP77 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SSU72Q9NP77 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SSU72Q9NP77 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SSU72Q9NP77 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SSU72Q9NP77 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SSU72Q9NP77 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SSU72Q9NP77 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SSU72Q9NP77 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SSU72Q9NP77 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SSU72Q9NP77 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSU72Q9NP77 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSU72Q9NP77 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSU72Q9NP77 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSU72Q9NP77 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SSU72Q9NP77 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSU72Q9NP77 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSU72Q9NP77 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSU72Q9NP77 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSU72Q9NP77 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSU72Q9NP77 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSU72Q9NP77 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSU72Q9NP77 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSU72Q9NP77 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSU72Q9NP77 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSU72Q9NP77 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSU72Q9NP77 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSU72Q9NP77 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSU72Q9NP77 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SSU72Q9NP77 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSU72Q9NP77 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms