Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCB6Q9NP58 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCB6Q9NP58 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCB6Q9NP58 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCB6Q9NP58 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCB6Q9NP58 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCB6Q9NP58 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCB6Q9NP58 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCB6Q9NP58 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCB6Q9NP58 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCB6Q9NP58 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCB6Q9NP58 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCB6Q9NP58 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCB6Q9NP58 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCB6Q9NP58 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCB6Q9NP58 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCB6Q9NP58 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCB6Q9NP58 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCB6Q9NP58 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCB6Q9NP58 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCB6Q9NP58 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCB6Q9NP58 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCB6Q9NP58 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCB6Q9NP58 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCB6Q9NP58 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCB6Q9NP58 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCB6Q9NP58 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCB6Q9NP58 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCB6Q9NP58 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCB6Q9NP58 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ABCB6Q9NP58 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCB6Q9NP58 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCB6Q9NP58 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCB6Q9NP58 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCB6Q9NP58 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCB6Q9NP58 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCB6Q9NP58 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCB6Q9NP58 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCB6Q9NP58 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCB6Q9NP58 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCB6Q9NP58 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCB6Q9NP58 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCB6Q9NP58 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCB6Q9NP58 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCB6Q9NP58 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCB6Q9NP58 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCB6Q9NP58 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCB6Q9NP58 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCB6Q9NP58 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCB6Q9NP58 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCB6Q9NP58 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCB6Q9NP58 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCB6Q9NP58 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCB6Q9NP58 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCB6Q9NP58 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCB6Q9NP58 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCB6Q9NP58 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCB6Q9NP58 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCB6Q9NP58 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCB6Q9NP58 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCB6Q9NP58 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ABCB6Q9NP58 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCB6Q9NP58 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCB6Q9NP58 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCB6Q9NP58 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCB6Q9NP58 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCB6Q9NP58 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCB6Q9NP58 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCB6Q9NP58 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCB6Q9NP58 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCB6Q9NP58 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCB6Q9NP58 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ABCB6Q9NP58 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCB6Q9NP58 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCB6Q9NP58 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ABCB6Q9NP58 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCB6Q9NP58 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCB6Q9NP58 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCB6Q9NP58 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCB6Q9NP58 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCB6Q9NP58 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCB6Q9NP58 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCB6Q9NP58 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCB6Q9NP58 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCB6Q9NP58 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCB6Q9NP58 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCB6Q9NP58 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCB6Q9NP58 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCB6Q9NP58 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCB6Q9NP58 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCB6Q9NP58 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCB6Q9NP58 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCB6Q9NP58 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCB6Q9NP58 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCB6Q9NP58 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCB6Q9NP58 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCB6Q9NP58 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCB6Q9NP58 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCB6Q9NP58 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCB6Q9NP58 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms