Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STN1Q9H668 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STN1Q9H668 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STN1Q9H668 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STN1Q9H668 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STN1Q9H668 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STN1Q9H668 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STN1Q9H668 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STN1Q9H668 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STN1Q9H668 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STN1Q9H668 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STN1Q9H668 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STN1Q9H668 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STN1Q9H668 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STN1Q9H668 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STN1Q9H668 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STN1Q9H668 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STN1Q9H668 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STN1Q9H668 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STN1Q9H668 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STN1Q9H668 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STN1Q9H668 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
STN1Q9H668 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
STN1Q9H668 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STN1Q9H668 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STN1Q9H668 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
STN1Q9H668 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
STN1Q9H668 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
STN1Q9H668 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STN1Q9H668 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STN1Q9H668 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STN1Q9H668 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STN1Q9H668 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
STN1Q9H668 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STN1Q9H668 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STN1Q9H668 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
STN1Q9H668 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STN1Q9H668 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
STN1Q9H668 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
STN1Q9H668 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
STN1Q9H668 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
STN1Q9H668 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STN1Q9H668 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STN1Q9H668 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STN1Q9H668 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STN1Q9H668 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STN1Q9H668 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
STN1Q9H668 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STN1Q9H668 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
STN1Q9H668 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
STN1Q9H668 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
STN1Q9H668 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
STN1Q9H668 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STN1Q9H668 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STN1Q9H668 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
STN1Q9H668 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STN1Q9H668 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STN1Q9H668 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STN1Q9H668 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STN1Q9H668 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
STN1Q9H668 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STN1Q9H668 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STN1Q9H668 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STN1Q9H668 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STN1Q9H668 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STN1Q9H668 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STN1Q9H668 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
STN1Q9H668 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STN1Q9H668 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STN1Q9H668 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STN1Q9H668 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STN1Q9H668 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STN1Q9H668 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STN1Q9H668 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STN1Q9H668 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STN1Q9H668 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STN1Q9H668 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
STN1Q9H668 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STN1Q9H668 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STN1Q9H668 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
STN1Q9H668 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STN1Q9H668 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
STN1Q9H668 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STN1Q9H668 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
STN1Q9H668 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STN1Q9H668 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STN1Q9H668 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STN1Q9H668 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STN1Q9H668 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STN1Q9H668 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STN1Q9H668 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STN1Q9H668 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STN1Q9H668 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STN1Q9H668 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STN1Q9H668 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STN1Q9H668 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STN1Q9H668 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STN1Q9H668 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STN1Q9H668 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STN1Q9H668 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms