Protein–RNA interactions for Protein: Q9H361

PABPC3, Polyadenylate-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC3Q9H361 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PABPC3Q9H361 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PABPC3Q9H361 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PABPC3Q9H361 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PABPC3Q9H361 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PABPC3Q9H361 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PABPC3Q9H361 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PABPC3Q9H361 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PABPC3Q9H361 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PABPC3Q9H361 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PABPC3Q9H361 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PABPC3Q9H361 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PABPC3Q9H361 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PABPC3Q9H361 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PABPC3Q9H361 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PABPC3Q9H361 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PABPC3Q9H361 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PABPC3Q9H361 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PABPC3Q9H361 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PABPC3Q9H361 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PABPC3Q9H361 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PABPC3Q9H361 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PABPC3Q9H361 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PABPC3Q9H361 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PABPC3Q9H361 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PABPC3Q9H361 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PABPC3Q9H361 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PABPC3Q9H361 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PABPC3Q9H361 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PABPC3Q9H361 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PABPC3Q9H361 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PABPC3Q9H361 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PABPC3Q9H361 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PABPC3Q9H361 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PABPC3Q9H361 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PABPC3Q9H361 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PABPC3Q9H361 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PABPC3Q9H361 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PABPC3Q9H361 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PABPC3Q9H361 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PABPC3Q9H361 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PABPC3Q9H361 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PABPC3Q9H361 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PABPC3Q9H361 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PABPC3Q9H361 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PABPC3Q9H361 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PABPC3Q9H361 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PABPC3Q9H361 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PABPC3Q9H361 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PABPC3Q9H361 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PABPC3Q9H361 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PABPC3Q9H361 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PABPC3Q9H361 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PABPC3Q9H361 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PABPC3Q9H361 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PABPC3Q9H361 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PABPC3Q9H361 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PABPC3Q9H361 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PABPC3Q9H361 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PABPC3Q9H361 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PABPC3Q9H361 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PABPC3Q9H361 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PABPC3Q9H361 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PABPC3Q9H361 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC3Q9H361 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PABPC3Q9H361 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PABPC3Q9H361 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PABPC3Q9H361 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PABPC3Q9H361 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PABPC3Q9H361 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PABPC3Q9H361 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PABPC3Q9H361 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PABPC3Q9H361 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PABPC3Q9H361 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PABPC3Q9H361 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PABPC3Q9H361 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PABPC3Q9H361 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PABPC3Q9H361 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PABPC3Q9H361 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PABPC3Q9H361 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PABPC3Q9H361 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PABPC3Q9H361 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PABPC3Q9H361 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PABPC3Q9H361 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PABPC3Q9H361 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PABPC3Q9H361 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PABPC3Q9H361 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PABPC3Q9H361 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PABPC3Q9H361 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PABPC3Q9H361 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PABPC3Q9H361 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PABPC3Q9H361 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PABPC3Q9H361 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PABPC3Q9H361 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PABPC3Q9H361 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PABPC3Q9H361 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PABPC3Q9H361 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PABPC3Q9H361 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PABPC3Q9H361 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PABPC3Q9H361 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms