Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E3

SAP130, Histone deacetylase complex subunit SAP130, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP130Q9H0E3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAP130Q9H0E3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAP130Q9H0E3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SAP130Q9H0E3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAP130Q9H0E3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAP130Q9H0E3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAP130Q9H0E3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAP130Q9H0E3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAP130Q9H0E3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAP130Q9H0E3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAP130Q9H0E3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SAP130Q9H0E3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAP130Q9H0E3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAP130Q9H0E3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAP130Q9H0E3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAP130Q9H0E3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAP130Q9H0E3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAP130Q9H0E3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAP130Q9H0E3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAP130Q9H0E3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAP130Q9H0E3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SAP130Q9H0E3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAP130Q9H0E3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAP130Q9H0E3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAP130Q9H0E3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAP130Q9H0E3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAP130Q9H0E3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAP130Q9H0E3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAP130Q9H0E3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAP130Q9H0E3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAP130Q9H0E3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAP130Q9H0E3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAP130Q9H0E3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAP130Q9H0E3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAP130Q9H0E3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAP130Q9H0E3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SAP130Q9H0E3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAP130Q9H0E3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAP130Q9H0E3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAP130Q9H0E3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAP130Q9H0E3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAP130Q9H0E3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAP130Q9H0E3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAP130Q9H0E3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAP130Q9H0E3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAP130Q9H0E3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SAP130Q9H0E3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAP130Q9H0E3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SAP130Q9H0E3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAP130Q9H0E3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAP130Q9H0E3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAP130Q9H0E3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAP130Q9H0E3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SAP130Q9H0E3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAP130Q9H0E3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAP130Q9H0E3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAP130Q9H0E3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAP130Q9H0E3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAP130Q9H0E3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAP130Q9H0E3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAP130Q9H0E3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAP130Q9H0E3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAP130Q9H0E3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAP130Q9H0E3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAP130Q9H0E3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAP130Q9H0E3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAP130Q9H0E3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SAP130Q9H0E3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAP130Q9H0E3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAP130Q9H0E3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAP130Q9H0E3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SAP130Q9H0E3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAP130Q9H0E3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAP130Q9H0E3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAP130Q9H0E3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAP130Q9H0E3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAP130Q9H0E3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAP130Q9H0E3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAP130Q9H0E3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAP130Q9H0E3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAP130Q9H0E3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAP130Q9H0E3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAP130Q9H0E3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAP130Q9H0E3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAP130Q9H0E3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAP130Q9H0E3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAP130Q9H0E3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAP130Q9H0E3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SAP130Q9H0E3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SAP130Q9H0E3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SAP130Q9H0E3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAP130Q9H0E3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAP130Q9H0E3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAP130Q9H0E3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAP130Q9H0E3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAP130Q9H0E3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAP130Q9H0E3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAP130Q9H0E3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAP130Q9H0E3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAP130Q9H0E3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1327.2 ms