Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C8

ILKAP, Integrin-linked kinase-associated serine/threonine phosphatase 2C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILKAPQ9H0C8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ILKAPQ9H0C8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ILKAPQ9H0C8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ILKAPQ9H0C8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ILKAPQ9H0C8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ILKAPQ9H0C8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ILKAPQ9H0C8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ILKAPQ9H0C8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ILKAPQ9H0C8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ILKAPQ9H0C8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ILKAPQ9H0C8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ILKAPQ9H0C8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ILKAPQ9H0C8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ILKAPQ9H0C8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ILKAPQ9H0C8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ILKAPQ9H0C8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ILKAPQ9H0C8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ILKAPQ9H0C8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ILKAPQ9H0C8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ILKAPQ9H0C8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ILKAPQ9H0C8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ILKAPQ9H0C8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ILKAPQ9H0C8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ILKAPQ9H0C8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ILKAPQ9H0C8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ILKAPQ9H0C8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ILKAPQ9H0C8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ILKAPQ9H0C8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ILKAPQ9H0C8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ILKAPQ9H0C8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ILKAPQ9H0C8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ILKAPQ9H0C8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ILKAPQ9H0C8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ILKAPQ9H0C8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ILKAPQ9H0C8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ILKAPQ9H0C8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ILKAPQ9H0C8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ILKAPQ9H0C8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ILKAPQ9H0C8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ILKAPQ9H0C8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ILKAPQ9H0C8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ILKAPQ9H0C8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ILKAPQ9H0C8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ILKAPQ9H0C8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ILKAPQ9H0C8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ILKAPQ9H0C8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ILKAPQ9H0C8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ILKAPQ9H0C8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ILKAPQ9H0C8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ILKAPQ9H0C8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ILKAPQ9H0C8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ILKAPQ9H0C8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ILKAPQ9H0C8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ILKAPQ9H0C8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ILKAPQ9H0C8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ILKAPQ9H0C8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ILKAPQ9H0C8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ILKAPQ9H0C8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ILKAPQ9H0C8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ILKAPQ9H0C8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ILKAPQ9H0C8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ILKAPQ9H0C8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ILKAPQ9H0C8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ILKAPQ9H0C8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ILKAPQ9H0C8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ILKAPQ9H0C8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ILKAPQ9H0C8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ILKAPQ9H0C8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ILKAPQ9H0C8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ILKAPQ9H0C8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ILKAPQ9H0C8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ILKAPQ9H0C8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ILKAPQ9H0C8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ILKAPQ9H0C8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ILKAPQ9H0C8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ILKAPQ9H0C8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ILKAPQ9H0C8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ILKAPQ9H0C8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ILKAPQ9H0C8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ILKAPQ9H0C8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ILKAPQ9H0C8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ILKAPQ9H0C8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ILKAPQ9H0C8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ILKAPQ9H0C8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ILKAPQ9H0C8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ILKAPQ9H0C8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ILKAPQ9H0C8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ILKAPQ9H0C8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ILKAPQ9H0C8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ILKAPQ9H0C8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ILKAPQ9H0C8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ILKAPQ9H0C8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ILKAPQ9H0C8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ILKAPQ9H0C8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ILKAPQ9H0C8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ILKAPQ9H0C8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ILKAPQ9H0C8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ILKAPQ9H0C8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ILKAPQ9H0C8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ILKAPQ9H0C8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms