Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf50Q9BV19 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
C1orf50Q9BV19 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
C1orf50Q9BV19 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
C1orf50Q9BV19 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1orf50Q9BV19 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1orf50Q9BV19 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1orf50Q9BV19 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1orf50Q9BV19 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf50Q9BV19 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf50Q9BV19 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf50Q9BV19 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf50Q9BV19 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf50Q9BV19 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf50Q9BV19 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf50Q9BV19 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1orf50Q9BV19 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf50Q9BV19 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf50Q9BV19 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1orf50Q9BV19 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1orf50Q9BV19 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1orf50Q9BV19 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf50Q9BV19 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf50Q9BV19 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1orf50Q9BV19 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C1orf50Q9BV19 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
C1orf50Q9BV19 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1orf50Q9BV19 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1orf50Q9BV19 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1orf50Q9BV19 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1orf50Q9BV19 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1orf50Q9BV19 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1orf50Q9BV19 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1orf50Q9BV19 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1orf50Q9BV19 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf50Q9BV19 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf50Q9BV19 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C1orf50Q9BV19 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1orf50Q9BV19 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C1orf50Q9BV19 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1orf50Q9BV19 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1orf50Q9BV19 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1orf50Q9BV19 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C1orf50Q9BV19 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
C1orf50Q9BV19 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C1orf50Q9BV19 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1orf50Q9BV19 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf50Q9BV19 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf50Q9BV19 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf50Q9BV19 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf50Q9BV19 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf50Q9BV19 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf50Q9BV19 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf50Q9BV19 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1orf50Q9BV19 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1orf50Q9BV19 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1orf50Q9BV19 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1orf50Q9BV19 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1orf50Q9BV19 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1orf50Q9BV19 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf50Q9BV19 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf50Q9BV19 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf50Q9BV19 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf50Q9BV19 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf50Q9BV19 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf50Q9BV19 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf50Q9BV19 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf50Q9BV19 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf50Q9BV19 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf50Q9BV19 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C1orf50Q9BV19 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C1orf50Q9BV19 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1orf50Q9BV19 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1orf50Q9BV19 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C1orf50Q9BV19 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf50Q9BV19 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf50Q9BV19 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf50Q9BV19 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf50Q9BV19 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf50Q9BV19 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf50Q9BV19 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf50Q9BV19 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf50Q9BV19 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf50Q9BV19 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C1orf50Q9BV19 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf50Q9BV19 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf50Q9BV19 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf50Q9BV19 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf50Q9BV19 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf50Q9BV19 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf50Q9BV19 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1orf50Q9BV19 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf50Q9BV19 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf50Q9BV19 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1orf50Q9BV19 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1orf50Q9BV19 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1orf50Q9BV19 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1orf50Q9BV19 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1orf50Q9BV19 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1orf50Q9BV19 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms