Protein–RNA interactions for Protein: Q99728

BARD1, BRCA1-associated RING domain protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARD1Q99728 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BARD1Q99728 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BARD1Q99728 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BARD1Q99728 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BARD1Q99728 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BARD1Q99728 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BARD1Q99728 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BARD1Q99728 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BARD1Q99728 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BARD1Q99728 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BARD1Q99728 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BARD1Q99728 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BARD1Q99728 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BARD1Q99728 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BARD1Q99728 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BARD1Q99728 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BARD1Q99728 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BARD1Q99728 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BARD1Q99728 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BARD1Q99728 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BARD1Q99728 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BARD1Q99728 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BARD1Q99728 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BARD1Q99728 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BARD1Q99728 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BARD1Q99728 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BARD1Q99728 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BARD1Q99728 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BARD1Q99728 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BARD1Q99728 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BARD1Q99728 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BARD1Q99728 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BARD1Q99728 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BARD1Q99728 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BARD1Q99728 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BARD1Q99728 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BARD1Q99728 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BARD1Q99728 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BARD1Q99728 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BARD1Q99728 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BARD1Q99728 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BARD1Q99728 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BARD1Q99728 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BARD1Q99728 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BARD1Q99728 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BARD1Q99728 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BARD1Q99728 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BARD1Q99728 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BARD1Q99728 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BARD1Q99728 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BARD1Q99728 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BARD1Q99728 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BARD1Q99728 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BARD1Q99728 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BARD1Q99728 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BARD1Q99728 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BARD1Q99728 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BARD1Q99728 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BARD1Q99728 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BARD1Q99728 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BARD1Q99728 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BARD1Q99728 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BARD1Q99728 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BARD1Q99728 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BARD1Q99728 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BARD1Q99728 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BARD1Q99728 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BARD1Q99728 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BARD1Q99728 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BARD1Q99728 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BARD1Q99728 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BARD1Q99728 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BARD1Q99728 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BARD1Q99728 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BARD1Q99728 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BARD1Q99728 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BARD1Q99728 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BARD1Q99728 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BARD1Q99728 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BARD1Q99728 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BARD1Q99728 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BARD1Q99728 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BARD1Q99728 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BARD1Q99728 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BARD1Q99728 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BARD1Q99728 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BARD1Q99728 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BARD1Q99728 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BARD1Q99728 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BARD1Q99728 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BARD1Q99728 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BARD1Q99728 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BARD1Q99728 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BARD1Q99728 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BARD1Q99728 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BARD1Q99728 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BARD1Q99728 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BARD1Q99728 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BARD1Q99728 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BARD1Q99728 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms