Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV6

HIST1H2AA, Histone H2A type 1-A, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H2AAQ96QV6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIST1H2AAQ96QV6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIST1H2AAQ96QV6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIST1H2AAQ96QV6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIST1H2AAQ96QV6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIST1H2AAQ96QV6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST1H2AAQ96QV6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIST1H2AAQ96QV6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIST1H2AAQ96QV6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIST1H2AAQ96QV6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST1H2AAQ96QV6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST1H2AAQ96QV6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST1H2AAQ96QV6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST1H2AAQ96QV6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST1H2AAQ96QV6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST1H2AAQ96QV6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST1H2AAQ96QV6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST1H2AAQ96QV6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIST1H2AAQ96QV6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIST1H2AAQ96QV6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIST1H2AAQ96QV6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIST1H2AAQ96QV6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HIST1H2AAQ96QV6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST1H2AAQ96QV6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST1H2AAQ96QV6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIST1H2AAQ96QV6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HIST1H2AAQ96QV6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST1H2AAQ96QV6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST1H2AAQ96QV6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST1H2AAQ96QV6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST1H2AAQ96QV6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST1H2AAQ96QV6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIST1H2AAQ96QV6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIST1H2AAQ96QV6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIST1H2AAQ96QV6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIST1H2AAQ96QV6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIST1H2AAQ96QV6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIST1H2AAQ96QV6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIST1H2AAQ96QV6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIST1H2AAQ96QV6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HIST1H2AAQ96QV6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIST1H2AAQ96QV6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIST1H2AAQ96QV6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIST1H2AAQ96QV6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIST1H2AAQ96QV6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HIST1H2AAQ96QV6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIST1H2AAQ96QV6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HIST1H2AAQ96QV6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIST1H2AAQ96QV6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIST1H2AAQ96QV6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HIST1H2AAQ96QV6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIST1H2AAQ96QV6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIST1H2AAQ96QV6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIST1H2AAQ96QV6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIST1H2AAQ96QV6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIST1H2AAQ96QV6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIST1H2AAQ96QV6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIST1H2AAQ96QV6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIST1H2AAQ96QV6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIST1H2AAQ96QV6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIST1H2AAQ96QV6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HIST1H2AAQ96QV6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIST1H2AAQ96QV6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIST1H2AAQ96QV6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIST1H2AAQ96QV6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIST1H2AAQ96QV6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIST1H2AAQ96QV6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIST1H2AAQ96QV6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIST1H2AAQ96QV6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIST1H2AAQ96QV6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIST1H2AAQ96QV6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIST1H2AAQ96QV6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIST1H2AAQ96QV6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HIST1H2AAQ96QV6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms