Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC38A2Q96QD8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC38A2Q96QD8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A2Q96QD8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A2Q96QD8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC38A2Q96QD8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC38A2Q96QD8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC38A2Q96QD8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC38A2Q96QD8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC38A2Q96QD8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC38A2Q96QD8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC38A2Q96QD8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC38A2Q96QD8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC38A2Q96QD8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A2Q96QD8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A2Q96QD8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC38A2Q96QD8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC38A2Q96QD8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC38A2Q96QD8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC38A2Q96QD8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC38A2Q96QD8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC38A2Q96QD8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC38A2Q96QD8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC38A2Q96QD8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC38A2Q96QD8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC38A2Q96QD8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC38A2Q96QD8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC38A2Q96QD8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC38A2Q96QD8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC38A2Q96QD8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC38A2Q96QD8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC38A2Q96QD8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC38A2Q96QD8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC38A2Q96QD8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC38A2Q96QD8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC38A2Q96QD8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A2Q96QD8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A2Q96QD8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC38A2Q96QD8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A2Q96QD8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A2Q96QD8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A2Q96QD8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC38A2Q96QD8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A2Q96QD8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC38A2Q96QD8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC38A2Q96QD8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC38A2Q96QD8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A2Q96QD8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A2Q96QD8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A2Q96QD8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A2Q96QD8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A2Q96QD8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A2Q96QD8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC38A2Q96QD8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A2Q96QD8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A2Q96QD8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC38A2Q96QD8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A2Q96QD8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC38A2Q96QD8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A2Q96QD8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC38A2Q96QD8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A2Q96QD8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A2Q96QD8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A2Q96QD8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC38A2Q96QD8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A2Q96QD8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A2Q96QD8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A2Q96QD8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC38A2Q96QD8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC38A2Q96QD8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC38A2Q96QD8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A2Q96QD8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A2Q96QD8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC38A2Q96QD8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC38A2Q96QD8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A2Q96QD8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A2Q96QD8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC38A2Q96QD8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A2Q96QD8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A2Q96QD8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC38A2Q96QD8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A2Q96QD8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A2Q96QD8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC38A2Q96QD8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC38A2Q96QD8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC38A2Q96QD8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC38A2Q96QD8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC38A2Q96QD8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC38A2Q96QD8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC38A2Q96QD8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC38A2Q96QD8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A2Q96QD8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A2Q96QD8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A2Q96QD8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A2Q96QD8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC38A2Q96QD8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC38A2Q96QD8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A2Q96QD8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC38A2Q96QD8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 757.6 ms